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yangyingwe

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】请教关于电子密度分布图的问题已有3人参与

请教哪位高手,如何将MS中的电子密度分布图保存为论文中可以用的平面电子密度分布图,而且要美观的那种,大家帮帮忙呀,谢谢哦
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zzgyb

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MS中如何做二维电子密度图

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
gavinliu7390(金币+3):谢谢交流! 2010-06-07 22:39:43
xiaohunhun(金币+3):谢谢 2010-06-08 15:54:37
1、首先计算出电子密度,这个不用讲了;
2、然后,选中3D原子文件,分析,选电子密度,同时选上等值面;
3、先save-->.grd文件。
它的文件格式为:
a b c Charge
1 1 1 20.4291333179468
2 1 1 21.703304660858524
3 1 1 25.528902136817084
4 1 1 31.530000049221105
5 1 1 39.074431775541491
6 1 1 46.869700929673286
....................................................
4、这时候你如果import的话,就会看见电子密度图了。
5、下面就到问题的关键了,用MATLAB转换绘图。
1)从上面的文件内容我们可以知道,其内容格式十分整齐,就是a b c 坐标然后跟着该点上的电荷密度,而且坐标都是整数。
比如计算的材料是正交系的,三个角都是直角,而且a b c的值都是1到45,你就可以可以偷懒。
2)数据的输入及转换
在MATLAB中,用csvread先读入电子密度,设为V;
再重整:V=RESHAPE(v,45,45,45);

3)坐标点的整理
先在MS中确定用a面,就是b,c面,和a轴垂直的,那个面(100),得到一组
normal和 position属性,position假定为3.17
然后mesh格点:

[sy,sz]=meshgrid(1:45,1:45)
sx=zeros(45,45)+3.17
这样数据就整理好了。
4)绘图
绘图:
contourslice(V,sx,sy,sz)

[ Last edited by zzgyb on 2010-6-8 at 12:28 ]
江南七怪+马玉+洪七公+一灯大师+周伯通教一个弱智儿童=郭靖,天下第一王重阳教七个天资不错的小孩=全真七子,全真七子×3《郭靖,这就是盲目扩招的后果
2楼2010-06-07 11:31:01
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yangyingwe

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by zzgyb at 2010-06-07 11:31:01:
1、首先计算出电子密度,这个不用讲了;
2、然后,选中3D原子文件,分析,选电子密度,同时选上等值面;
3、先save-->好像和acridine兄说的不同,没有发现有.grd文件,但是目录中会多出一个.charg_frm文件 ...

非常感谢,谢谢啦
3楼2010-06-08 09:00:54
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guolianshun

金虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by yangyingwe at 2010-06-08 09:00:54:
非常感谢,谢谢啦

你好看懂了吗,怎么选择等值面呀?谢谢
4楼2011-09-23 16:56:17
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guolianshun

金虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by zzgyb at 2010-06-07 11:31:01:
1、首先计算出电子密度,这个不用讲了;
2、然后,选中3D原子文件,分析,选电子密度,同时选上等值面;
3、先save-->.grd文件。
它的文件格式为:
a b c Charge
1 1 1 20.4291333179468
2 1 1 21.70 ...

怎么选择等值面呀?谢谢
5楼2011-09-23 16:58:58
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