应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Abinit » 【求助】abinit 内存要2.73G,算不动咋办？
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
111/1返回列表
查看: 2008  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

oscar5667

新虫 (著名写手)

[交流] 【求助】abinit 内存要2.73G,算不动咋办？

算个晶体的介电常数，23个原子，弄好了输入文件和赝势文件，

计算1秒钟后出log说内存需要2783.030 Mbytes
================================================================================
P This job should need less than                    2783.030 Mbytes of memory.
  Rough estimation (10% accuracy) of disk space for files :
  WF disk file :    901.760 Mbytes ; DEN or POT disk file :      0.529 Mbytes.
STOP 1
================================================================================

Biggest array : cg(disk), with    901.7598 MBytes.
memana : allocated an array of    901.760 Mbytes, for testing purposes.

memana : ERROR -
  Test failed to allocate    2783.030 Mbytes
  It is not worth to continue
  Action : modify input variable to fit the available memory.
  or increase limit on available memory.
===========================================================================
我这体系是不是太大了，我的工作站是4个G内存，我还以为够了，是不是abinit分派不了这么大的内存呢？谢谢专家指教！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-01-18 17:33:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lbambool

木虫 (著名写手)
★
zzy870720z(金币+1): 谢谢交流 2011-01-18 19:41:44
oscar5667(金币+1): 2011-01-19 10:39:00
你4G内存是几核共用？提交时是只用一个核心算还是多核？四核的话一个核只有1G了。有些操作系统还有单 进程2G内存的限制，你查一下你的系统。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-01-18 19:07:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

frank_zhan

金虫 (正式写手)
★
oscar5667(金币+1): 2011-01-19 16:23:03
zhang668(金币+1): 多谢提示 2011-01-19 21:04:01
可否把k点的数量减少一些，这样应该是可以减少内存的使用量。
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-01-19 09:42:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yy08

木虫 (著名写手)
★
zhang668(金币+1): 多谢交流 2011-01-19 21:04:13
引用回帖:
Originally posted by lbambool at 2011-01-18 19:07:14:
你4G内存是几核共用？提交时是只用一个核心算还是多核？四核的话一个核只有1G了。有些操作系统还有单 进程2G内存的限制，你查一下你的系统。

是这样的，所以你只能用一个核去算。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-01-19 10:15:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

oscar5667

新虫 (著名写手)

谢谢

引用回帖:
Originally posted by lbambool at 2011-01-18 19:07:14:
你4G内存是几核共用？提交时是只用一个核心算还是多核？四核的话一个核只有1G了。有些操作系统还有单 进程2G内存的限制，你查一下你的系统。

谢谢哦，呵呵！
我的工作站是DELL T3400 两核。用的是centos 5.5系统，abinit5.7.3

提交时我也不知道是用几个核？是在输入文件里面设定吗？

刚刚接触abinit不久，不好意思！
赞一下 回复此楼
5楼2011-01-19 10:42:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lbambool

木虫 (著名写手)
两个核，每个核只分2G了
赞一下 回复此楼
6楼2011-01-19 12:07:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

oscar5667

新虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by lbambool at 2011-01-19 12:07:50:
两个核，每个核只分2G了

哦，是这样，有没有什么方法可以充分利用4G的内存？呵呵
要不就算不了了，嗨！
赞一下 回复此楼
7楼2011-01-19 13:20:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lbambool

木虫 (著名写手)
★
zzy870720z(金币+1): 谢谢交流 2011-01-19 16:08:37
我没有用过abinit，但一般的软件的设置里会有限制用最大的内存，那样软件会想办法在硬盘上开辟空间来交换数据，使物理内存小于预算内存时可以进行计算，你看一下软件的说明书。
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2011-01-19 14:07:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

oscar5667

新虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by lbambool at 2011-01-19 14:07:29:
我没有用过abinit，但一般的软件的设置里会有限制用最大的内存，那样软件会想办法在硬盘上开辟空间来交换数据，使物理内存小于预算内存时可以进行计算，你看一下软件的说明书。

ok，好的，谢谢专家解答，嘿嘿
赞一下 回复此楼
9楼2011-01-19 16:23:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lbambool

木虫 (著名写手)
惭愧啊，我不是专家
赞一下 回复此楼
10楼2011-01-19 17:11:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ljludwig

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
晕，这个办法有好多种。

第一种是减少energy cutoff，即ecut;
第二种是减少K-mesh.

但是这样都不能保证收敛。所以如果保证收敛的情况下，

可以设置mkmem, mffmem等，这样的话就不通过内存来算，而是暂时存在disk上。
这样会慢一些，但是会解决内存的问题。

设置方法在帮助说明里都有：
http://www.abinit.org/documentat ... /varfil.html#mffmem

[ Last edited by ljludwig on 2013-2-7 at 03:26 ]
赞一下 回复此楼
11楼2013-02-07 03:25:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 oscar5667 的主题更新
111/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +4 月@163.com 2026-04-07 4/200 2026-04-07 14:54 by 懒虫儿坤
[考研] 288求调剂 +11 没有答案_ 2026-04-05 11/550 2026-04-07 14:35 by qlm5820
[考研] 生物学363调剂求助 +5 fanzhang6666 2026-04-06 6/300 2026-04-07 11:13 by 好运来2024
[考研] 一志愿郑州大学085600求调剂 +20 吃的不少 2026-04-05 23/1150 2026-04-07 10:05 by 猪会飞
[考研] 336求调剂，一志愿中科大 +7 墨彧 yuyu 2026-04-06 7/350 2026-04-07 08:58 by Jaylen.
[硕博家园] 0856材料化工求调剂，一志愿211，初试成绩349 +4 江淮北月 2026-04-05 4/200 2026-04-06 22:44 by chenzhimin
[考研] 338求调剂 +4 wxygxsaaaaa 2026-04-06 4/200 2026-04-06 17:14 by 尚水阁主
[考研] 求调剂 +4 wos666 2026-04-03 5/250 2026-04-06 15:22 by wos666
[考研] 301求调剂 +7 细胞相关蛋白 2026-04-03 7/350 2026-04-06 11:47 by lijunpoly
[考研] 材料334求调剂 +19 Eecho# 2026-04-03 19/950 2026-04-06 08:37 by 小小树2024
[考研] 341求调剂 +3 学无止境，冲 2026-04-05 3/150 2026-04-05 09:40 by lbsjt
[考研] 353求调剂 +10 MayUxw1 2026-04-03 10/500 2026-04-05 09:23 by 无际的草原
[考研] 环境285分，过六级，求调剂 +10 xhr12 2026-04-02 10/500 2026-04-04 21:53 by bn53987
[考研] 298求调剂 +5 zzz，，r 2026-04-02 8/400 2026-04-04 19:55 by 蓝云思雨
[考研] 266求调剂 +8 学员97LZgn 2026-04-03 8/400 2026-04-04 09:02 by 20021109
[考研] 学硕288调剂!!! +3 小王xw123 2026-04-03 3/150 2026-04-03 21:20 by 啵啵啵0119
[考研] 材料专硕322分 +11 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-01 11/550 2026-04-02 10:52 by lnilvy
[考研] 江苏科技大学招材料研究生 +4 Su032713. 2026-04-01 5/250 2026-04-01 22:03 by cccchenso
[考研] 379求调剂 +3 ?苦瓜不苦 2026-04-01 3/150 2026-04-01 20:09 by 暮云清寒
[考研] 301求调剂 +8 axibli 2026-04-01 8/400 2026-04-01 09:51 by 我的船我的海
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭