24小时热门版块排行榜

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

小木虫于

金虫 (正式写手)

应助: 5 (幼儿园)
金币: 1052.9
帖子: 419
在线: 293.1小时
虫号: 1027530

[交流] 【求助】哪位有siesta-3.0-rc2呀？

哪位有siesta-3.0-2啊，我的是beta 编译时都能通过，单核能算但多核并行就有问题，用mpich2和openmpi都有问题，网上说的很多办法都试了，都不行，想试一下siesta-3.0-rc2，能奉献一下么?万分感谢。
我邮箱yugd10@mails.jlu.edu.cn

回复此楼

» 猜你喜欢

2025年遐想已经有4人回复
投稿Elsevier的杂志（返修），总是在选择OA和subscription界面被踢皮球已经有8人回复
自然科学基金委宣布启动申请书“瘦身提质”行动已经有4人回复
求个博导看看已经有18人回复

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

哪位大侠帮忙看下这个化验单，谢谢！已经有18人回复
【原创】成功编译siesta-3.0-rc1 已经有3人回复
【求助】请教在ATK中怎样使用自己的或者Siesta的赝势已经有4人回复
【求助】siesta3.0 安装，错误一箩筐已经有11人回复
【分享】EndNote Update X3.0.1 for Windows 已经有8人回复
【求助】siesta3.0 算输运，怎么能像atk那样方便的加多个电压？已经有17人回复

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴

1楼 2011-01-18 16:14:24

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫于(金币+1):谢谢参与
sunyang1988(金币+2): 谢谢交流 2011-01-18 17:32:36
小木虫于(金币+1): 2011-01-18 17:40:28

引用回帖:

Originally posted by 小木虫于 at 2011-01-18 09:14:24:
哪位有siesta-3.0-2啊，我的是beta 编译时都能通过，单核能算但多核并行就有问题，用mpich2和openmpi都有问题，网上说的很多办法都试了，都不行，想试一下siesta-3.0-rc2，能奉献一下么?万分感谢。
我邮箱[ema ...

这个和版本没有关系，和你的编译有关系。就如楼上的所说，试试吧。如果是Intel的内核，建议用openmpi,我的没有发现有什么问题。并行不成功，一般说来是因为mpi的问题。不要使用ifort11编译，尽量使用ifort10或者ifort9。
另外能不能给出一个并行失败的例子。包括输入文件,出错信息。

[ Last edited by zhangguangping on 2011-1-18 at 10:36 ]

赞一下(2人)

回复此楼

3楼2011-01-18 17:26:09

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)

小木虫于(金币+10): 非常感谢 2011-01-18 21:49:35

引用回帖:

源代码的压缩包已经发到你的邮箱了。

赞一下

回复此楼

4楼2011-01-18 20:26:06

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+3): 谢谢讨论 2011-01-18 22:27:22

引用回帖:

Originally posted by 小木虫于 at 2011-01-18 14:46:11:

十分感谢，我后来发现，由于我用的是mkl库，如果我不用/mkl/bin/em64t/下的blas与lapack，二十重新编译/mkl/interface/lapack95与/mkl/interface/blas95这两个库，用重新编译的blas与lapack就行了，但是在并行计 ...

不知道你用的mkl是什么版本，建议用和ifort版本相近的。不要使用过高的版本。
我的mkl的em64t是没有blas的，只有lapack，但是我没有直接使用这个。
是编译的时候使用的库函数是：
BLAS_LIBS=-L/home/zhanggp/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_solver_lp64 -lmkl_intel_lp64 -lguide
LAPACK_LIBS=-L/home/zhanggp/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_sequential -lmkl_core
BLACS_LIBS=-L/home/zhanggp/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_blacs_openmpi_lp64
SCALAPACK_LIBS=-L/home/zhanggp/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_scalapack_lp64
在使用blacs的时候由于我使用的是openmpi，所以选择的是这个。
我去测试了一下你说的那个例子，我的串行能算，但是并行的时候也是不能算。
具体的错误是cell的分配问题。
  Cells per Processor =       0    36
  Cells per Processor =       1       0
  Cells per Processor =       2       0
  Cells per Processor =       3       0

Warning: Bad load balancing: no cells allocated to node          1
Try specifying a number of nodes that is
an exact factor of the number of cells:       36
ERROR STOP from Node: 0
ERROR STOP from Node: 0
--------------------------------------------------------------------------
MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD
with errorcode 1.

NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes.
You may or may not see output from other processes, depending on
exactly when Open MPI kills them.
--------------------------------------------------------------------------
--------------------------------------------------------------------------
mpirun has exited due to process rank 0 with PID 29111 on
node localhost exiting without calling "finalize". This may
have caused other processes in the application to be
terminated by signals sent by mpirun (as reported here).
--------------------------------------------------------------------------
我平时不使用这个Ordern方法。
我记得群里有人使用Ordern方法。可以问一下他们是怎么编译的。估计这个方法的使用可能和编译时有关系的。

赞一下(2人)

回复此楼

6楼2011-01-18 22:17:43

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖