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【求助】关于CASTEP吸附模拟求助
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如图所示 我想模拟个分子吸附到晶面表面的模型，以前一直用的是discover模块，最近看了一些文献，上面用到了castep模块算吸附，所以打算用这个模块来模拟我研究的体系吸附。 吸附的方法：首先分别对分子和晶面进行优化，得到其能量Emole和Eslab 然后将优化后的分子放到也已经优化的晶面的表面，然后再进行优化，得到能量Etot Eads = Etot - Emole - Eslab 问题：1. 优化时用几何优化这个任务吗？ 2. 能量是几何优化后的out文件中的能量吗？还是接着优化过的构型算能量任务？ 3. 我用FIND在out文件找能量，发现有很多而且很多都是重复的能量，那么哪一个是我要的呢？有没有标识呀？ 4. 我用dmol3可以算分子的几何优化，可是castep就不可以了，怎么才可以优化这个分子呀？我想不可能给分子加一个晶胞吧... 先提这么多问题吧，希望有人能够耐心解决下哈，非常感谢...   |
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7楼2012-03-03 23:48:55
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cg陈(金币+10):恩 谢谢 2011-01-07 20:19:45
gzqdyouxia(金币+2):谢谢提示 2011-01-07 20:25:40
cg陈(金币+10):恩 谢谢 2011-01-07 20:19:45
gzqdyouxia(金币+2):谢谢提示 2011-01-07 20:25:40
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1. 是用几何优化。 2. 就在几何优化的out文件中找能量。 3. Press CTRL + F and search for Final Enthalpy. Note down the value that appears in that line. 4. 确实要加一个周期性格子才能算小分子。 具体可参见软件自带的Tutorials Adsorption of CO onto a Pd(110) Surface |
3楼2011-01-07 19:46:01
4楼2011-01-07 20:29:46