应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】菜鸟 求助批量化合物转化为3D
91/1返回列表
查看: 1149  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

山石岩

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】菜鸟 求助批量化合物转化为3D

求助




        我对设计不是很了解，现在想转化一批化合物为3D结构，大概有几万个化合物。这些化合物的格式都是sd的。

        开始用DS的Build 3D database .发现1000个化合物转化用了12个小时，崩溃了。 请教下大家：这么长时间正常吗？还是用错了模块或者软件？还有什么方法能比这个快一点？具体要怎么操作啊？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2010-12-31 09:45:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yalefield

金虫 (文坛精英)
★
山石岩(金币+1): 2011-01-10 18:59:55
zh1987hs(金币+1):谢谢 2011-01-11 22:38:18
openbabel
回复此楼
2楼2011-01-01 09:15:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
山石岩(金币+1): 2011-01-10 19:00:01
zh1987hs(金币+1):谢谢 2011-01-11 22:38:07
zh1987hs(金币+1):谢谢 2011-01-11 22:38:25
SYBYL的concord
回复此楼
4楼2011-01-02 09:23:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

houxuben

木虫 (正式写手)
★
山石岩(金币+1): 2011-01-10 19:01:34
zh1987hs(金币+1):谢谢 2011-01-11 22:37:55
同意楼上
SYBYL的concord转换8W个化合物也就是十来分钟
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2011-01-02 23:21:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

山石岩

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 山石岩 at 2010-12-31 09:45:28:
求助




        我对设计不是很了解，现在想转化一批化合物为3D结构，大概有几万个化合物。这些化合物的格式都是sd的。

        开始用DS的Build 3D database .发现1000个化合物转化用了12个小时，崩溃 ...

谢谢！
回复此楼
6楼2011-01-10 18:59:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

山石岩

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by CYXLP at 2011-01-01 09:40:51:

谢谢
回复此楼
7楼2011-01-10 19:00:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

山石岩

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by tjegg at 2011-01-02 09:23:20:
SYBYL的concord

谢谢！
回复此楼
8楼2011-01-10 19:01:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

山石岩

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by houxuben at 2011-01-02 23:21:26:
同意楼上
SYBYL的concord转换8W个化合物也就是十来分钟

谢谢
回复此楼
9楼2011-01-10 19:01:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
CYXLP3楼
2011-01-01 09:40   回复  
相关版块跳转 我要订阅楼主 山石岩 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 5BDX0d0WFp7t 2026-09-15 4/200 2026-09-17 16:29 by 0ngsZVSCTS7z
[找工作] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 vZfe6xYu34yj 2026-09-14 3/150 2026-09-17 15:27 by 0ngsZVSCTS7z
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 40ms4Wlo4umh 2026-09-14 6/300 2026-09-17 13:53 by ObVzqQQh1rrE
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 23jxep3nCNZb 2026-09-14 4/200 2026-09-17 13:51 by ObVzqQQh1rrE
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 yaCh4X3wd045 2026-09-14 4/200 2026-09-17 13:17 by ObVzqQQh1rrE
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 vZfe6xYu34yj 2026-09-14 4/200 2026-09-17 05:50 by k06BKNblrGRH
[硕博家园] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 vZfe6xYu34yj 2026-09-14 3/150 2026-09-17 05:16 by k06BKNblrGRH
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 40ms4Wlo4umh 2026-09-14 4/200 2026-09-17 04:28 by k06BKNblrGRH
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 40ms4Wlo4umh 2026-09-14 4/200 2026-09-17 04:26 by k06BKNblrGRH
[公派出国] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 7/350 2026-09-17 02:14 by Tql5LQhh5rLK
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +6 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 8/400 2026-09-17 02:04 by Tql5LQhh5rLK
[考研] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +7 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 7/350 2026-09-17 01:52 by Tql5LQhh5rLK
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-16 17:12 by i3KBRD19ERkG
[考博] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +7 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 7/350 2026-09-16 14:36 by i3KBRD19ERkG
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 6/300 2026-09-16 14:27 by i3KBRD19ERkG
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +7 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 7/350 2026-09-16 02:35 by DgNGHc3h5tPl
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 5/250 2026-09-16 02:14 by DgNGHc3h5tPl
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +7 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 7/350 2026-09-15 16:23 by CgyNCDVNhGVg
[教师之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 08:14 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-15 07:50 by C79jjtjAKjEn
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭