应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】菜鸟 求助批量化合物转化为3D
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 986  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

山石岩

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】菜鸟 求助批量化合物转化为3D

求助




        我对设计不是很了解，现在想转化一批化合物为3D结构，大概有几万个化合物。这些化合物的格式都是sd的。

        开始用DS的Build 3D database .发现1000个化合物转化用了12个小时，崩溃了。 请教下大家：这么长时间正常吗？还是用错了模块或者软件？还有什么方法能比这个快一点？具体要怎么操作啊？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2010-12-31 09:45:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

山石岩

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by CYXLP at 2011-01-01 09:40:51:

谢谢
回复此楼
7楼2011-01-10 19:00:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

houxuben

木虫 (正式写手)
★
山石岩(金币+1): 2011-01-10 19:01:34
zh1987hs(金币+1):谢谢 2011-01-11 22:37:55
同意楼上
SYBYL的concord转换8W个化合物也就是十来分钟
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2011-01-02 23:21:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

山石岩

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 山石岩 at 2010-12-31 09:45:28:
求助




        我对设计不是很了解，现在想转化一批化合物为3D结构，大概有几万个化合物。这些化合物的格式都是sd的。

        开始用DS的Build 3D database .发现1000个化合物转化用了12个小时，崩溃 ...

谢谢！
回复此楼
6楼2011-01-10 18:59:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

山石岩

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by tjegg at 2011-01-02 09:23:20:
SYBYL的concord

谢谢！
回复此楼
8楼2011-01-10 19:01:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 复试调剂，一志愿南农083200食品科学与工程 +5 XQTJZ 2026-03-26 5/250 2026-03-27 14:49 by 狂炫麦当当
[考研] 0703化学一志愿南京师范大学303求调剂 +3 zzffylgg 2026-03-24 3/150 2026-03-27 10:42 by shangxh
[考研] 材料学硕333求调剂 +8 北道巷 2026-03-24 8/400 2026-03-27 10:18 by 我是小康
[考研] 316求调剂 +5 江辞666 2026-03-26 5/250 2026-03-27 08:08 by hypershenger
[考研] 329求调剂 +7 钮恩雪 2026-03-25 7/350 2026-03-27 04:28 by wxiongid
[考研] 一志愿郑州大学，080500学硕，总分317分求调剂 +4 举个栗子oi 2026-03-24 5/250 2026-03-26 23:15 by 不吃魚的貓
[考研] 297求调剂 +6 田洪有 2026-03-26 6/300 2026-03-26 15:55 by 不吃魚的貓
[考研] 一志愿河工大 081700 276求调剂 +4 地球绕着太阳转 2026-03-23 4/200 2026-03-26 14:27 by zzll406
[考研] 材料专硕 335 分求调剂 +4 拒绝冷暴力 2026-03-25 4/200 2026-03-25 18:45 by haxia
[考研] 各位老师您好：本人初试372分 +5 jj涌77 2026-03-25 6/300 2026-03-25 14:15 by mapenggao
[考研] 0854电子信息求调剂 324 +4 Promise-jyl 2026-03-23 4/200 2026-03-25 11:36 by Sugarlight
[考研] 一志愿北化315 求调剂 +3 akrrain 2026-03-24 3/150 2026-03-24 19:35 by 了了了了。。
[考研] 080500求调剂 +3 zzzzfan 2026-03-24 3/150 2026-03-24 16:38 by barlinike
[考研] 291求调剂 +3 HanBeiNingZC 2026-03-24 3/150 2026-03-24 16:34 by barlinike
[考研] 求调剂一志愿武汉理工大学材料工程（085601） +5 WW.' 2026-03-23 7/350 2026-03-24 14:50 by sprinining
[考研] 085404电子信息284分求调剂 +4 13659058978 2026-03-24 4/200 2026-03-24 12:15 by syl20081243
[考研] 一志愿河北工业大学0817化工278分求调剂 +7 jhybd 2026-03-23 12/600 2026-03-24 09:03 by jhybd
[考研] 291求调剂 +5 孅華 2026-03-22 5/250 2026-03-23 09:20 by haoshis
[考研] 306求调剂 +5 来好运来来来 2026-03-22 5/250 2026-03-22 16:17 by BruceLiu320
[考研] 285求调剂 +6 ytter 2026-03-22 6/300 2026-03-22 12:09 by 星空星月
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭