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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】这个错误是怎么回事呢？
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小鱼-xf

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】这个错误是怎么回事呢？

麻烦帮忙看下这个错误是怎么回事。非常谢谢！

输入
%mem=400MW
%NprocShared=8
%LindaWorker=node5-ib
%nprocshared=8
%chk=9-px
#p pbe1pbe/6-311g(d) td(singlets,nstates=60,root=1) geom=check  gfinput gfprint iop(6/7=3)

molecule 1+2+3+2

0 1


输出结果
Bad file opened by FileIO:  Unit=2 LstWrd= 120586240 LenFil= 120574129 NIntWP=1.
FileIO: IOper= 9 IFilNo(1)=     2 Len=           0 IPos=           0 Q=          6554520


dumping /fiocom/, unit = 1 NFiles =     1 SizExt =    524288 WInBlk =       512
                   defal = T LstWrd =       65536 FType=2 FMxFil=10000

Number           0
Base         40448
End          65536
End1         65536
Wr Pntr      40448
Rd Pntr      40448
Length       25088
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.
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1楼 2010-12-28 14:25:06
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小鱼-xf

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by mchen10 at 2010-12-29 12:29:48:
it could be the case 2L mentions. Either the chk file is bad (i.e., previous calculation is not normally ended), or it is from a different version  of gaussian.

g09 cannot directly read the g03  ...

我用的一直是G09版本的，应该是CHK文件读入的问题。
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8楼2010-12-29 17:16:14
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fatpig8832

铁杆木虫 (著名写手)
小鱼-xf(金币+1):谢谢！ 2010-12-28 19:22:46
看样子是读取chk文件出错...
赞一下 回复此楼
2楼2010-12-28 17:42:19
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★
小鱼-xf(金币+4):非常感谢您解释的这么详细！ 2010-12-28 19:24:33
erylingjet(金币+5):Perfect! 2010-12-28 23:01:55
从Bad file opened by FileIO和NtrErr Called from FileIO看，显然是文件读写错误。
从dumping /fiocom/看，显然是linux操作系统，那么一般不会是由于单个文件超过2G造成的限制，从LindaWorker=node5-ib看，你的机器是通过网络进行并行的，那么极大的可能是网络中断造成读写错误，或者是scr目录被写满，硬盘空间不够造成的。
从LenFil= 120574129 看，才写了120M就出错，硬盘空间不够的可能性不大，所以网络故障是最大的可能。
你没有明确说是运行了一段时间还是刚运行就出错。如果是运行很长一段时间，那么就是刚才说的原因，如果是刚运行就出这个问题，那么可能是linux系统的设置问题，要取消linux的读写缓存功能即可。
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3楼2010-12-28 17:48:50
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小鱼-xf

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zhangmt at 2010-12-28 17:48:50:
从Bad file opened by FileIO和NtrErr Called from FileIO看，显然是文件读写错误。
从dumping /fiocom/看，显然是linux操作系统，那么一般不会是由于单个文件超过2G造成的限制，从LindaWorker=node5-ib看，你的 ...

是刚运行一会就出错了，我这是UNIX的，弱弱的问一下怎么改变读写缓存功能呢？
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4楼2010-12-28 19:25:59
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