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小鱼-xf

金虫 (正式写手)


[交流] 【求助】这个错误是怎么回事呢?

麻烦帮忙看下这个错误是怎么回事。非常谢谢!

输入
%mem=400MW
%NprocShared=8
%LindaWorker=node5-ib
%nprocshared=8
%chk=9-px
#p pbe1pbe/6-311g(d) td(singlets,nstates=60,root=1) geom=check  gfinput gfprint iop(6/7=3)

molecule 1+2+3+2

0 1


输出结果
Bad file opened by FileIO:  Unit=2 LstWrd= 120586240 LenFil= 120574129 NIntWP=1.
FileIO: IOper= 9 IFilNo(1)=     2 Len=           0 IPos=           0 Q=          6554520


dumping /fiocom/, unit = 1 NFiles =     1 SizExt =    524288 WInBlk =       512
                   defal = T LstWrd =       65536 FType=2 FMxFil=10000

Number           0
Base         40448
End          65536
End1         65536
Wr Pntr      40448
Rd Pntr      40448
Length       25088
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.
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小鱼-xf

金虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by mscic at 2010-12-29 14:39:27:
应该是读取CHK文件出错,你的CHK文件不存在或者不在当前指定的路径

geom=check  

请确定你的CHK文件存在,并且在你的提交的这个作业的目录下面,否则是无法读取的。

呵呵,我已经把CHK文件重新读入了,这次应该没什么问题了!
7楼2010-12-29 17:14:58
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查看全部 8 个回答

fatpig8832

铁杆木虫 (著名写手)


小鱼-xf(金币+1):谢谢! 2010-12-28 19:22:46
看样子是读取chk文件出错...
2楼2010-12-28 17:42:19
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)


★ ★ ★ ★ ★
小鱼-xf(金币+4):非常感谢您解释的这么详细! 2010-12-28 19:24:33
erylingjet(金币+5):Perfect! 2010-12-28 23:01:55
从Bad file opened by FileIO和NtrErr Called from FileIO看,显然是文件读写错误。
从dumping /fiocom/看,显然是linux操作系统,那么一般不会是由于单个文件超过2G造成的限制,从LindaWorker=node5-ib看,你的机器是通过网络进行并行的,那么极大的可能是网络中断造成读写错误,或者是scr目录被写满,硬盘空间不够造成的。
从LenFil= 120574129 看,才写了120M就出错,硬盘空间不够的可能性不大,所以网络故障是最大的可能。
你没有明确说是运行了一段时间还是刚运行就出错。如果是运行很长一段时间,那么就是刚才说的原因,如果是刚运行就出这个问题,那么可能是linux系统的设置问题,要取消linux的读写缓存功能即可。
3楼2010-12-28 17:48:50
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小鱼-xf

金虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by zhangmt at 2010-12-28 17:48:50:
从Bad file opened by FileIO和NtrErr Called from FileIO看,显然是文件读写错误。
从dumping /fiocom/看,显然是linux操作系统,那么一般不会是由于单个文件超过2G造成的限制,从LindaWorker=node5-ib看,你的 ...

是刚运行一会就出错了,我这是UNIX的,弱弱的问一下怎么改变读写缓存功能呢?
4楼2010-12-28 19:25:59
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