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【问题征集讨论】CONTCAR中的原子名称说明行
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youzhizhe
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[交流]
【问题征集讨论】CONTCAR中的原子名称说明行
VASP5.2版本的CONTCAR出现了新的一行,即原子名称说明行
,我们按照以前的vasp指导手册时,经常会在这个问题上出现错误。比如晶体结构优化是,run_cell脚本的copy CONTCAR到POSCAR,这个就不可以继续使用,因为这样子POSCAR后面就不符合要求,程序会出错。
那么,我很想征集一下
针对VASP新版本的CONTCAR出现原子名称这新的一行所引起计算过程中出现的问题,以及大家对应解决的办法
,希望对各位VASP使用同仁有所帮助。
[
Last edited by youzhizhe on 2010-12-25 at 23:09
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2010-12-25 23:06:39
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youzhizhe
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引用回帖:
Originally posted by
hedaors
at 2011-01-06 09:57:03:
你实际计算了么?
vasp 5.2 的 poscar 就应该有原子名称那一行,只不过 vasp5.2 兼容 4.6 的格式,没有 原子名称那一行也行。
如果你真的不想要那一行,你可以在脚本里加入
sed -i '6,6d ...
计算发现POSCAR里面有原子名称行没问题
谢谢交流,尤其是针对在脚本中添加行的方法。
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7楼
2011-01-06 10:05:40
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先开一个头吧。
如上所说,晶体结构优化时,侯柱锋老师的入门指南第25页的run_cell脚本程序中“cp CONTCAR POSCAR” 这个就不可继续使用。
那么请问,各位是如何处理晶体结构优化的这种复杂情况(P23)呢?
[
Last edited by youzhizhe on 2010-12-25 at 23:38
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2010-12-25 23:13:03
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youzhizhe(金币+2):同意。 2010-12-25 23:33:35
zzy870720z(金币+1):谢谢参与 2011-01-06 14:07:00
copy CONTCAR到POSCAR是没有问题的,vasp5.2可以识别。但原来一些处理vasp输出结果的脚本可能需要做一些修改
在不同种类原子数目上面多了原子名称这一行的文件,我知道的有CONTCAR,CHGCAR,CHG。各个类CHGCAR文件PROCAR,LVTOT什么的应该都有
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2010-12-25 23:14:21
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sunyang1988(金币+1):谢谢交流 2010-12-26 08:10:28
这一行不是什么大问题,改改就行了
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4楼
2010-12-26 04:02:38
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