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coolrainbow

木虫 (著名写手)

未来国家冻凉

应助: 1 (幼儿园)
贵宾: 0.1
金币: 3979.5
散金: 10
红花: 50
帖子: 1137
在线: 272.3小时
虫号: 239560
注册: 2006-04-07
性别: GG
专业: 理论和计算化学

[交流] 【求助】那位知道哪款分子动力学软件支持GPU计算FEP（自由能微扰）？已有2人参与

我最近给机器装了个GPU，使得NAMD的速度提升了4倍，不幸的是，NAMD明确表示不支持GPU计算FEP，查了下，GROMACS也不行。哪位知道有没有动力学软件支持GPU算自由能的？谢谢

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1楼2010-12-21 08:34:21

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密集雨

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 182.5
帖子: 4
在线: 2小时
虫号: 1533911
注册: 2011-12-12
性别: GG
专业: 生物化学

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

这个貌似真没有，因为看样子是串行计算，没法利用大规模并行的GPU来加速。

3楼2020-09-24 11:27:00

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wally8962

木虫 (著名写手)

应助: 9 (幼儿园)
金币: 5366.7
红花: 2
帖子: 1062
在线: 471.1小时
虫号: 600024
注册: 2008-09-12
性别: GG
专业: 生物力学

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流

林中7鸟，不如手中一鸟。

赞一下(2人)

2楼2010-12-21 15:58:59

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