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倚门回首

金虫 (小有名气)


[交流] 【求助】π-π堆积的垂直距离怎么看?

我用platon找到π-π的计算数据,但是我看不懂这里的三组数据要选取那个作为垂直距离呢?


(Cg\(I\) Res\(I\)   Cg\(J\)  [   ARU\(J\)]       Cg-Cg Transformed J-Plane P, Q, R, S     Alpha  Beta Gamma    CgI_Perp    CgJ_Perp  Slippage)s
( )s
(Cg3    [ 1] -> Cg3    [  2545.01]    5.417\(4\)  0.2784 0.6770-0.6813  -1.6592        85 33.81 65.01    2.288\(2\)   -4.501\(2\))s
(Cg3    [ 1] -> Cg3    [  3566.01]    3.747\(4\)  0.2784-0.6770-0.6813  -8.5487         0 27.68 27.68    3.318\(2\)    3.319\(2\)   1.741)s
(Cg3    [ 1] -> Cg3    [  4554.01]    5.985\(4\) -0.2784-0.6770 0.6813  -1.6592        85  5.24 80.09    1.030\(2\)   -5.959\(2\))s
(                                   ----------                                 --------------------------------------------)s
(                            Min or Max  3.747                                     0.00  5.24 80.09       1.030      -5.959)s
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0000372

木虫 (正式写手)



倚门回首(金币+1):谢谢参与
帝夫:感谢您的回复! 2010-12-20 15:28:00
用platon怎麽计算π-π作用?具体怎么操作啊? 请帮忙
5楼2010-12-19 20:22:13
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查看全部 19 个回答

fanghua3062

铁杆木虫 (小有名气)


★ ★ ★
倚门回首(金币+1):谢谢参与
帝夫(金币+2):感谢您的回复! 2010-12-20 15:27:36
-在platon.list文件中你截取的这段数据的上方有关于每列数据的解释啊:
Cg(I)    = Plane number I (= ring number in () above)
- Alpha    = Dihedral Angle between Planes I and J (Deg)
- Beta     = Angle Cg(I)-->Cg(J) or Cg(I)-->Me vector and normal to plane I (Deg)
- Gamma    = Angle Cg(I)-->Cg(J) vector and normal to plane J (Deg)
- Cg-Cg    = Distance between ring Centroids (Ang.)
- CgI_Perp = Perpendicular distance of Cg(I) on ring J (Ang.)
- CgJ_Perp = Perpendicular distance of Cg(J) on ring I (Ang.)
- Slippage = Distance between Cg(I) and Perpendicular Projection of Cg(J) on Ring I (Ang).
- P,Q,R,S  = J-Plane Parameters for Carth. Coord. (Xo, Yo, Zo)
一般需要用到的数据是二面角Alpha 和质心间距离Cg-Cg 。
2楼2010-12-19 16:40:11
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hjh509

铁杆木虫 (职业作家)



倚门回首(金币+1):谢谢参与
帝夫:感谢您的回复! 2010-12-20 15:27:51
楼上的解释王道哈,原来不知道呢
3楼2010-12-19 18:55:26
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guochi

金虫 (正式写手)



倚门回首(金币+1):谢谢参与
帝夫:感谢您的回复! 2010-12-20 15:27:55
用platon怎麽计算π-π作用?具体怎么操作啊?
4楼2010-12-19 20:18:56
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