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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 【求助】π-π堆积的垂直距离怎么看？
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倚门回首

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】π-π堆积的垂直距离怎么看？

我用platon找到π-π的计算数据，但是我看不懂这里的三组数据要选取那个作为垂直距离呢？


(Cg\(I\) Res\(I\)   Cg\(J\)  [   ARU\(J\)]       Cg-Cg Transformed J-Plane P, Q, R, S     Alpha  Beta Gamma    CgI_Perp    CgJ_Perp  Slippage)s
( )s
(Cg3    [ 1] -> Cg3    [  2545.01]    5.417\(4\)  0.2784 0.6770-0.6813  -1.6592        85 33.81 65.01    2.288\(2\)   -4.501\(2\))s
(Cg3    [ 1] -> Cg3    [  3566.01]    3.747\(4\)  0.2784-0.6770-0.6813  -8.5487         0 27.68 27.68    3.318\(2\)    3.319\(2\)   1.741)s
(Cg3    [ 1] -> Cg3    [  4554.01]    5.985\(4\) -0.2784-0.6770 0.6813  -1.6592        85  5.24 80.09    1.030\(2\)   -5.959\(2\))s
(                                   ----------                                 --------------------------------------------)s
(                            Min or Max  3.747                                     0.00  5.24 80.09       1.030      -5.959)s
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1楼 2010-12-19 11:31:34
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fanghua3062

铁杆木虫 (小有名气)
★ ★ ★
倚门回首(金币+1):谢谢参与
帝夫(金币+2):感谢您的回复！ 2010-12-20 15:27:36
-在platon.list文件中你截取的这段数据的上方有关于每列数据的解释啊:
Cg(I)    = Plane number I (= ring number in () above)
- Alpha    = Dihedral Angle between Planes I and J (Deg)
- Beta     = Angle Cg(I)-->Cg(J) or Cg(I)-->Me vector and normal to plane I (Deg)
- Gamma    = Angle Cg(I)-->Cg(J) vector and normal to plane J (Deg)
- Cg-Cg    = Distance between ring Centroids (Ang.)
- CgI_Perp = Perpendicular distance of Cg(I) on ring J (Ang.)
- CgJ_Perp = Perpendicular distance of Cg(J) on ring I (Ang.)
- Slippage = Distance between Cg(I) and Perpendicular Projection of Cg(J) on Ring I (Ang).
- P,Q,R,S  = J-Plane Parameters for Carth. Coord. (Xo, Yo, Zo)
一般需要用到的数据是二面角Alpha 和质心间距离Cg-Cg 。
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2楼2010-12-19 16:40:11
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hjh509

铁杆木虫 (职业作家)
★
倚门回首(金币+1):谢谢参与
帝夫:感谢您的回复！ 2010-12-20 15:27:51
楼上的解释王道哈，原来不知道呢
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2010-12-19 18:55:26
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guochi

金虫 (正式写手)
★
倚门回首(金币+1):谢谢参与
帝夫:感谢您的回复！ 2010-12-20 15:27:55
用platon怎麽计算π-π作用？具体怎么操作啊？
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2010-12-19 20:18:56
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0000372

木虫 (正式写手)
★
倚门回首(金币+1):谢谢参与
帝夫:感谢您的回复！ 2010-12-20 15:28:00
用platon怎麽计算π-π作用？具体怎么操作啊？ 请帮忙
赞一下(2人) 回复此楼
5楼2010-12-19 20:22:13
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倚门回首

金虫 (小有名气)
帝夫:感谢您的回复！ 2010-12-20 15:28:04
引用回帖:
Originally posted by fanghua3062 at 2010-12-19 16:40:11:
-在platon.list文件中你截取的这段数据的上方有关于每列数据的解释啊:
Cg(I)    = Plane number I (= ring number in () above)
- Alpha    = Dihedral Angle between Planes I and J (Deg)
- Beta     = Ang ...

但是，在数据上有三组CgI_Perp    CgJ_Perp的数据，我应该选取那个作为π-π之间的垂直距离呢？
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6楼2010-12-20 09:14:45
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倚门回首

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by guochi at 2010-12-19 20:18:56:
用platon怎麽计算π-π作用？具体怎么操作啊？

我是在网上搜索的
http://muchong.com/html/200908/1466681.html
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7楼2010-12-20 09:25:02
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倚门回首

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 0000372 at 2010-12-19 20:22:13:
用platon怎麽计算π-π作用？具体怎么操作啊？ 请帮忙

我是在网上搜到的
http://muchong.com/html/200908/1466681.html
你看看吧
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8楼2010-12-20 09:25:37
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dongyang5028

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
倚门回首(金币+1):谢谢参与
帝夫(金币+2):感谢您的回复！ 2010-12-20 15:28:15
倚门回首(金币+5): 2010-12-21 15:05:03
Cg3    [ 1] -> Cg3    [  3566.01]    3.747\(4\)

其他两个太大了都五点多了

这个都偏大了，勉强算堆积作用吧
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9楼2010-12-20 09:57:26
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huadong1985

木虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
帝夫(金币+1):感谢您的回复！ 2010-12-20 15:28:22
weak \pi...\pi stacking interactions           3.747
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10楼2010-12-20 10:26:30
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倚门回首

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by dongyang5028 at 2010-12-20 09:57:26:
Cg3    [ 1] -> Cg3    [  3566.01]    3.747\(4\)

其他两个太大了都五点多了

这个都偏大了，勉强算堆积作用吧

这个就是质心见的距离吗？那么垂直距离3.318和3.319要选择哪个呢？
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11楼2010-12-20 10:33:03
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guochi

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 倚门回首 at 2010-12-20 09:25:37:

我是在网上搜到的
http://muchong.com/html/200908/1466681.html
你看看吧

谢谢你啊！
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12楼2010-12-20 11:16:24
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fmopily

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
帝夫(金币+1):感谢您的回复！ 2010-12-20 15:27:26
你的这个情况应该选Cg3[ 1] -> Cg3[  3566.01]   
Perpendicular distance  3.318(2)
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13楼2010-12-20 12:10:51
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dongyang5028

金虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
帝夫(金币+1):感谢您的回复！ 2010-12-20 15:27:21
选这个3.747(4) 这个是心心距离
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14楼2010-12-20 12:59:38
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dongyang5028

金虫 (正式写手)
帝夫:感谢您的回复！ 2010-12-20 15:27:16
和爱尔法
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15楼2010-12-20 13:02:46
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倚门回首

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by dongyang5028 at 2010-12-20 13:02:46:
和爱尔法

这是什么方法，在哪里能够找到？我没有听说过，在网上也没有查到。谢谢了！
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16楼2010-12-20 15:23:23
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dongyang5028

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 倚门回首 at 2010-12-20 15:23:23:

这是什么方法，在哪里能够找到？我没有听说过，在网上也没有查到。谢谢了！

不是方法，是CG-爱尔法对应的数值，倒数第二个那个数，位数是8不是9的那个，呵呵
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17楼2010-12-21 10:45:51
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dongyang5028

金虫 (正式写手)
3.318
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18楼2010-12-21 10:46:09
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倚门回首

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by dongyang5028 at 2010-12-21 10:45:51:

不是方法，是CG-爱尔法对应的数值，倒数第二个那个数，位数是8不是9的那个，呵呵

哦！明白了，谢谢你啊？
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19楼2010-12-21 15:04:21
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