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【讨论】关于驰豫的讨论
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各位大侠: 我有几个问题不是很明白,希望大家讨论下,说说自己的看法 (1)驰豫是什么 ? 在我看来,驰豫也是优化的一种方式(另一种是构型最优化,即求在0k下该构型的势能最小值,这时算的时候好像用的全是自由边界条件) (2)那驰豫应该在什么系综下进行?nve?npt? 还是nvt? 有的人说用nvt,我也不知道原因,也不知道为什么要用nvt?以及用nvt 跟用nve在驰豫中有什么本质上的差别? 我的看法是:用npt。因为在npt下,构型的box是可以改变的,那么原子的位置就能得到很好的松弛。 (3)驰豫过程中跟边界条件的关系。 我认为是很有关系的。在用nve的时候,我用s s s 边界好像也能得到驰豫,这时候的驰豫我想应该跟构型最优化差不多。边界条件只要不全是周期边界,nve就能驰豫 在lammps中而 nve+对原子的控温 应该也能达到驰豫的效果。 (4)驰豫到平衡态的标准是什么?? 我的看法是:系统的温度,能量,以及系统的压强都达到了一个平衡值。 有的看法是,压强要为0或者在0附件波动 谢谢大家能都谈谈自己的理解。 |
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黄随便(金币+10): 2011-05-30 14:54:42
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黄随便(金币+10): 2011-05-30 14:54:42
| 驰豫就是relax,就是松驰,释放内部应力,使系统达到平衡。因此分子模拟中所说的驰豫在广义上往往就是指的run。运行MD多少步,也可以说弛豫多少步。在什么条件下弛豫,看你的具体对象和过程。也有特定过程的驰豫,比如有的文献上说达到平衡后再驰豫多少步,等等,但仍然看不出来这个词和 run 有什么区别。总之所谓的“弛豫”,并不是一个专门有所指的术语,并不是特指的某一个过程,也不是限定在某个条件下进行的过程。 分子模拟的文献中出现几乎所有的”驰豫“两个字,如果换成”运行“,它的意思不会发生什么变化。驰豫多少步,基本上就等同于运行多少步的意思。因为驰豫二字强调的是应力松驰,而在某个指定条件下,任何成功的MD步所产生的都是这个效果,而不是相反。 |
2楼2010-12-14 11:31:57












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