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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 【求助/交流】PCR--小弟上图了，帮我看看图
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feiye2214

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】PCR--小弟上图了，帮我看看图 已有17人参与


这是我用其他物种唐鱼、鲤鱼的目的基因片段的引物去扩乌贼的这个目的片段，出现了很多条带（还有很多的相关引物正在做，先做的这两条），目的片段是b-actin，应该还算保守吧？
图：上面是唐鱼，下面是鲤鱼
从左至右是45-65度的退火温度梯度
本人觉得是引物特异性不高，因为前面45度时条带很多，到后面的65度又没有条带出现。
高手帮我出出主意，怎么能增加特异性扩增？

[ Last edited by feiye2214 on 2010-12-9 at 21:52 ]
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1楼 2010-12-09 21:27:31
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baihaer

铜虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
用普通PCR就行，把引物序列加长一点增加特异性，另外退火温度最好在55—60之间（不要低于53），适当调低一点退火温度引物和目的基因特异性结合下降可以增加产物，最简单的你可以多做几组平行然后把目的位置的胶切下来用一个柱子回收，这是最简单增加PCR产物的方法了。
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没有SB的事，只有SB的人
34楼2014-01-23 20:47:21
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yixuanwin

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
silicare(金币+1): 2010-12-28 14:04:20
乍一看还以为是筛ssr呢    引物特异性太低，重设计吧
赞一下(3人) 回复此楼
2楼2010-12-09 22:20:59
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引物特异性太差，另外可以试试touchdownPCR。
赞一下(1人) 回复此楼
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
3楼2010-12-09 22:27:56
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scelab

荣誉版主 (文坛精英)

小木虫之有关部门负责人
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by feiye2214 at 2010-12-09 21:27:31:
[img]这是我用其他物种唐鱼、鲤鱼的目的基因片段的引物去扩乌贼的这个目的片段，出现了很多条带（还有很多的相关引物正在做，先做的这两条），目的片段是 ...

很漂亮的说，请问你是什么marker，多大的胶？
赞一下(1人) 回复此楼
小木虫之有关部门负责人
4楼2010-12-09 22:32:15
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