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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【讨论】COMFA计算的主成分问题
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lvjuanhuhu

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【讨论】COMFA计算的主成分问题 已有6人参与

用sybyl做COMFA的时候，在PLS一步，需要设置主成分，缺省值为6，但我看过文献有取到13的，请教各位达人，主成分应该怎么取合适，越大越好吗？
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1楼 2010-12-05 20:41:07
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-12-06 12:13:18
应该是越小越好，但大小通常是根据 PRESS 来确定，PRESS 随着 LV 的增加，逐渐下降，然后平稳，通常 LV 为由下降变为平稳的那个拐点……
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2楼2010-12-05 21:20:36
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lvjuanhuhu

铜虫 (初入文坛)
谢谢，我还有个问题想请教，我在用PLS分析comfa结果的时候，采用的是留组法，但是我发现一个现象，前后分别作两次，任何参数都不改变，但是得到的Q平方的结果却是完全不相同，按照道理来说，不改变参数再重复前一次的实验，结果应该完全一致才对呀，这个是什么原因呢？
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3楼2010-12-09 15:36:25
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superfcc

禁虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+1): 谢谢 2011-07-15 22:55:13
本帖内容被屏蔽
4楼2011-03-14 16:15:30
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家强

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by lvjuanhuhu at 2010-12-05 20:41:07:
用sybyl做COMFA的时候，在PLS一步，需要设置主成分，缺省值为6，但我看过文献有取到13的，请教各位达人，主成分应该怎么取合适，越大越好吗？

这个主成分我看过文献设定的不一样，那我们做的时候怎么设定呢
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5楼2011-07-15 16:30:56
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bbslover

金虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
御剑江湖(金币+4): 谢谢 2011-07-31 19:41:18
引用回帖:
Originally posted by lvjuanhuhu at 2010-12-09 15:36:25:
谢谢，我还有个问题想请教，我在用PLS分析comfa结果的时候，采用的是留组法，但是我发现一个现象，前后分别作两次，任何参数都不改变，但是得到的Q平方的结果却是完全不相同，按照道理来说，不改变参数再重复前一 ...

你所说的"留组法"，每次得到的结果不一样就对了，因为每次分组的时候都是随机分的。 你可以多做几次分组验证，最后去平均值。

"留一法"就不会有随机的现象了。
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6楼2011-07-26 21:19:09
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chemozhang

木虫 (正式写手)
帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《Sybyl 常见问题及使用教程》
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故地如重游月圆更寂寞
7楼2011-09-05 19:01:22
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芒小果乐园

新虫 (初入文坛)
CoMFA菜鸟学习了
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就像干花的香，沉淀了思想。
8楼2012-02-27 11:23:15
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