应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】求博士论——文分子对接在药物设计中的应用
111/1返回列表
查看: 1928  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

sibsqq

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】求博士论——文分子对接在药物设计中的应用

上海药物所陈凯先，蒋华良的博士研究生罗小民的博士论文

药物设计新手的导读首选材料

　　　　　　　
　　目 录

文摘
英文文摘
第一章 分子对接及其在药物设计中的应用

1.1引言
1.2分子对接法的基本原理
1.3Docking
1.4DOCK

1.4.1形状匹配
1.4.2分而治之的匹配算法
1.4.3基于经验势能函数的评价函数
1.4.4柔性对接

1.5AutoDock

1.5.1评价函数
1.5.2柔性搜寻方法

1.6FlexX

1.6.1FlexX对化学现象的模拟
1.6.2对接算法

1.7FlexiDock

1.7.1FlexiDock预处理
1.7.2FlexiDock中的遗传算法

1.8分子对接在药物设计中的应用

1.8.1 HIV-1蛋白酶
1.8.2胸苷酸合成酶
1.8.3流行感冒血凝素
1.8.4寄生虫蛋白酶

1.9结语
参考文献

第二章 酪氨酸激酶抑制剂的分子设计及其与酪氨酸激酶的作用机理研究

2.1引言
2.2研究方法
2.3结果与讨论

2.3.1 DOCK 4.0能量与Sybyl分子力学能量特征
2.3.2分子结构特征

2.4药理测试
2.5结论
参考文献

第三章 乙酰胆碱酯酶抑制剂的数据库搜寻及其与乙酰胆碱酯酶的作用机理研究

3.1引言
3.2石杉碱甲衍生物与乙酰胆碱酯酶的作用机理

3.2.1研究方法
3.2.2结果与讨论
3.2.3小结

3.3利用三维药效基团搜寻以及分子对接方法寻找新型乙酰胆碱酯酶抑制剂

3.3.1研究方法
3.3.2结果与讨论

3.4利用分子对接方法从天然产物中搜寻乙酰胆碱酯酶抑制剂先导化合物

3.4.1研究方法
3.4.2结果与讨论
3.4.3小结

3.5结论
参考文献

第四章 白桦子酸及齐墩果酸类抗HIV试剂的定量构效关系研究

4.1引言
4.2研究方法
4.3结果与讨论
4.4结论
参考文献

第五章 分子对接程序DOCK 4.0在国产超级计算机上的并行化

5.1引言
5.2程序移植及并行化
5.3结果及讨论

5.3.1神威超级计算机，DEC alpha工作站计算结果与SGI 工作站计算结果比较
5.3.2并行分子对接的效率
5.3.3今后改进的方向

5.4结论
参考文献

Selected Publication


论坛里谁有这篇论文吗？可否共享下，最近课题需要做dock，急需protocol，谢谢啊。
回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

liucuicui

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2010-12-01 01:15:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
罗小民已经是很老的博士了，内容还很新吗？
赞一下 回复此楼
2楼2010-12-01 07:58:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sibsqq

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by tjegg at 2010-12-01 07:58:05:
罗小民已经是很老的博士了，内容还很新吗？

恩，因为我是初学者，所以想了解一些基本的原理，这些应该不会有太大的变化的。

请问，你有这个论文吗？如果有，可以发我一份吗？
wangqiustc@gmail.com
赞一下 回复此楼
3楼2010-12-01 09:17:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xgniu

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★
zh1987hs(金币+5):谢谢 2010-12-01 11:28:09
sibsqq(金币+10):谢谢你的提供，虽然我已经找到了，还是兑现奖励，以后多切磋，呵呵。 2010-12-01 20:04:54
http://good.gd/851643.htm
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-12-01 11:02:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

alphawei

金虫 (小有名气)
謝謝囉！不錯的資料！
赞一下 回复此楼
5楼2011-03-10 20:54:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xuoyugaoyu

金虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
谢谢各位！又下了点好资料
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2011-03-13 20:50:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

游子8921

铁杆木虫 (知名作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
楼主得到了吗？我也想要，谢谢。cuixiaobin2008@163.com
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2011-04-25 22:19:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ruofei16888

铜虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
楼主能给我发一份么，多谢！
yanxuxyyz@163.com
赞一下(1人) 回复此楼
9楼2011-12-31 03:41:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liucuicui

新虫 (小有名气)
送鲜花一朵
лл
回复此楼
10楼2012-03-23 16:07:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
weiwang25998楼
2011-05-04 16:46   回复  
引用回帖:
Originally posted by xgniu at 2010-12-01 11:02:35: http://good.gd/851643.htm

谢谢分享
ghlsx11楼
2015-07-31 00:34   回复  
好
相关版块跳转 我要订阅楼主 sibsqq 的主题更新
111/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +3 且听虎啸 2026-08-17 4/200 2026-08-17 22:31 by ccec101
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +36 医学老男孩 2026-08-13 85/4250 2026-08-17 21:23 by lcmdlut
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +5 angus9576 2026-08-17 9/450 2026-08-17 20:57 by ssxclkj
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +8 wangze12014 2026-08-14 10/500 2026-08-17 17:05 by xter9665
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？ +12 Ldrop2023 2026-08-13 15/750 2026-08-17 15:02 by 小豌豆_发芽
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +13 archvillain 2026-08-15 25/1250 2026-08-16 20:13 by zhaosm1982
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 6/300 2026-08-16 20:07 by 奶牛小黑
[基金申请] 快农历七夕节了，轻松一下，男人悄悄话，女施主请不要进来。 +3 Tide man 2026-08-14 3/150 2026-08-16 17:47 by jurkat.1640
[基金申请] 有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验） +10 majunge000 2026-08-11 12/600 2026-08-16 08:18 by xli1984
[精细化工] 招聘 金属平磨液，抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友，我要去昆明玩几天，回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果？ +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] 重要来源：本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了，巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 结合人工智能，周易传统文化，filecode打分制来了，3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭