应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】求博士论——文分子对接在药物设计中的应用
51/1返回列表
查看: 1741  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

sibsqq

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】求博士论——文分子对接在药物设计中的应用

上海药物所陈凯先，蒋华良的博士研究生罗小民的博士论文

药物设计新手的导读首选材料

　　　　　　　
　　目 录

文摘
英文文摘
第一章 分子对接及其在药物设计中的应用

1.1引言
1.2分子对接法的基本原理
1.3Docking
1.4DOCK

1.4.1形状匹配
1.4.2分而治之的匹配算法
1.4.3基于经验势能函数的评价函数
1.4.4柔性对接

1.5AutoDock

1.5.1评价函数
1.5.2柔性搜寻方法

1.6FlexX

1.6.1FlexX对化学现象的模拟
1.6.2对接算法

1.7FlexiDock

1.7.1FlexiDock预处理
1.7.2FlexiDock中的遗传算法

1.8分子对接在药物设计中的应用

1.8.1 HIV-1蛋白酶
1.8.2胸苷酸合成酶
1.8.3流行感冒血凝素
1.8.4寄生虫蛋白酶

1.9结语
参考文献

第二章 酪氨酸激酶抑制剂的分子设计及其与酪氨酸激酶的作用机理研究

2.1引言
2.2研究方法
2.3结果与讨论

2.3.1 DOCK 4.0能量与Sybyl分子力学能量特征
2.3.2分子结构特征

2.4药理测试
2.5结论
参考文献

第三章 乙酰胆碱酯酶抑制剂的数据库搜寻及其与乙酰胆碱酯酶的作用机理研究

3.1引言
3.2石杉碱甲衍生物与乙酰胆碱酯酶的作用机理

3.2.1研究方法
3.2.2结果与讨论
3.2.3小结

3.3利用三维药效基团搜寻以及分子对接方法寻找新型乙酰胆碱酯酶抑制剂

3.3.1研究方法
3.3.2结果与讨论

3.4利用分子对接方法从天然产物中搜寻乙酰胆碱酯酶抑制剂先导化合物

3.4.1研究方法
3.4.2结果与讨论
3.4.3小结

3.5结论
参考文献

第四章 白桦子酸及齐墩果酸类抗HIV试剂的定量构效关系研究

4.1引言
4.2研究方法
4.3结果与讨论
4.4结论
参考文献

第五章 分子对接程序DOCK 4.0在国产超级计算机上的并行化

5.1引言
5.2程序移植及并行化
5.3结果及讨论

5.3.1神威超级计算机，DEC alpha工作站计算结果与SGI 工作站计算结果比较
5.3.2并行分子对接的效率
5.3.3今后改进的方向

5.4结论
参考文献

Selected Publication


论坛里谁有这篇论文吗？可否共享下，最近课题需要做dock，急需protocol，谢谢啊。
回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

liucuicui

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2010-12-01 01:15:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xuoyugaoyu

金虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
谢谢各位！又下了点好资料
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2011-03-13 20:50:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
罗小民已经是很老的博士了，内容还很新吗？
赞一下 回复此楼
2楼2010-12-01 07:58:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sibsqq

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by tjegg at 2010-12-01 07:58:05:
罗小民已经是很老的博士了，内容还很新吗？

恩，因为我是初学者，所以想了解一些基本的原理，这些应该不会有太大的变化的。

请问，你有这个论文吗？如果有，可以发我一份吗？
wangqiustc@gmail.com
赞一下 回复此楼
3楼2010-12-01 09:17:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xgniu

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★
zh1987hs(金币+5):谢谢 2010-12-01 11:28:09
sibsqq(金币+10):谢谢你的提供，虽然我已经找到了，还是兑现奖励，以后多切磋，呵呵。 2010-12-01 20:04:54
http://good.gd/851643.htm
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-12-01 11:02:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
weiwang25998楼
2011-05-04 16:46   回复  
引用回帖:
Originally posted by xgniu at 2010-12-01 11:02:35: http://good.gd/851643.htm

谢谢分享
查看全部 11 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 情人节自我反思：在爱情中有过遗憾吗？ +5 瞬息宇宙 2026-02-15 6/300 2026-02-18 12:51 by 月下雪林
[找工作] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 i3cz6qj6l2 2026-02-17 3/150 2026-02-18 11:09 by lqtl9djx19
[考博] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 i3cz6qj6l2 2026-02-17 3/150 2026-02-18 10:54 by lqtl9djx19
[考研] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 i3cz6qj6l2 2026-02-17 3/150 2026-02-18 10:39 by lqtl9djx19
[考研] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 pnpwoqbg8f 2026-02-17 3/150 2026-02-18 08:53 by lqtl9djx19
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 pnpwoqbg8f 2026-02-17 3/150 2026-02-18 08:38 by lqtl9djx19
[找工作] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +4 pnpwoqbg8f 2026-02-17 4/200 2026-02-18 07:55 by lotyj5cz79
[基金申请] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 pnpwoqbg8f 2026-02-16 4/200 2026-02-18 07:40 by lotyj5cz79
[考研] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +4 pnpwoqbg8f 2026-02-16 4/200 2026-02-18 07:38 by lotyj5cz79
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +4 pnpwoqbg8f 2026-02-16 4/200 2026-02-18 07:23 by lotyj5cz79
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +4 pnpwoqbg8f 2026-02-16 4/200 2026-02-18 07:08 by lotyj5cz79
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 pnpwoqbg8f 2026-02-16 3/150 2026-02-18 06:53 by lotyj5cz79
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 pnpwoqbg8f 2026-02-17 3/150 2026-02-18 00:40 by tk2gfblvuz
[找工作] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 pnpwoqbg8f 2026-02-17 4/200 2026-02-18 00:23 by tk2gfblvuz
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急 +3 pnpwoqbg8f 2026-02-17 3/150 2026-02-17 23:40 by tk2gfblvuz
[基金申请] 基金正文30页指的是报告正文还是整个申请书 +3 successhe 2026-02-16 4/200 2026-02-17 20:56 by successhe
[基金申请] 今年春晚有几个节目很不错，点赞！ +5 瞬息宇宙 2026-02-16 6/300 2026-02-17 12:49 by jymy19840415
[微米和纳米] 球磨粉体时遇到了大的问题，请指教！ 10+3 6sbiam 2026-02-12 15/750 2026-02-16 15:03 by tgzxzqj
[基金申请] 过年走亲戚时感受到了所开私家车的鄙视链 +3 瞬息宇宙 2026-02-15 5/250 2026-02-16 14:23 by aspect3000
[硕博家园] 江汉大学解明教授课题组招博士研究生/博士后 +3 cleverlyy 2026-02-12 3/150 2026-02-12 21:02 by qsdf1
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭