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suny2005

木虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】g_density命令问题

最近做了一个两相体系的动力学模拟,我想用g_density命令分析一下两种物质的密度分布,所以用到了下面的命令g_density -f xx.xtc -s xx.tpr -n index.ndx -dens number -o dens.xvg。其中用-dens number主要是想获得两种分子的数量密度,但分析结束后发现结果好像不对,因为我的体系中两种分子的数量是相等的,如果分成两相的话,他们的数量密度也应当是相等的,但结果并不是这样,有人知道这是为什么吗?
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