24小时热门版块排行榜    

查看: 941  |  回复: 6

wanfei

金虫 (小有名气)


[交流] 【求助】纳米管问题

各位高手:
我现在在算药物分子与纳米管相互作用,纳米管算的时候用的是超晶包,药物-纳米管复合物也是超晶包,那么单独的药物分子计算时也需要把药物分子放在超晶包中计算吗?我看文献上算气体分子在纳米材料上吸附时,纳米管,纳米管-气体分子复合物都是放在晶包里算的,可是单独的气体分子没有放在晶包中。那么到底需不需要放啊?因为如果不放它就是非周期的,而其它的建了晶包的是周期性的啊。希望高手指点下,谢谢!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ym23

铁杆木虫 (著名写手)



zzy870720z(金币+1):谢谢交流 2010-11-17 08:24:09
wanfei(金币+1): 2010-11-17 17:42:24
还是需要的吧,不然你怎么比较能量呢?
2楼2010-11-16 23:14:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanfei

金虫 (小有名气)


可是许多人说小分子不需要放晶包算啊,我都弄不清楚了
3楼2010-11-17 17:42:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ustbwgs

木虫 (正式写手)



sunyang1988(金币+1):谢谢回复 2010-11-17 23:17:43
wanfei(金币+1): 2010-11-18 09:56:04
用VASP算得的话必须是周期性结构,你用什么软件算呢
4楼2010-11-17 23:02:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zsjan

金虫 (正式写手)



sunyang1988(金币+1):谢谢交流 2010-11-17 23:17:33
可以取足够大的晶胞,从而避免了镜像的相互作用!
5楼2010-11-17 23:05:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanfei

金虫 (小有名气)


我是用Dmol算的,需要放在晶包里面吗?要是需要晶包就用和纳米管晶包一样大小的就可以了吧
6楼2010-11-18 09:57:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ustbwgs

木虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★
youzhizhe(金币+2):谢谢交流。 2010-11-18 11:17:15
zzy870720z(金币+2):谢谢交流 2010-11-18 11:59:14
wanfei(金币+1):谢谢 2010-11-18 17:55:26
引用回帖:
Originally posted by wanfei at 2010-11-18 09:57:35:
我是用Dmol算的,需要放在晶包里面吗?要是需要晶包就用和纳米管晶包一样大小的就可以了吧

我也是做CTN的。
看样子你是想先把结合起来的E算出来,再把单独的算出来,然后相减来算它们的结合能吧,这样的话,你在计算单独(也就是分开的时候单个的)能量时,各自考虑各自的。晶胞的大小与碳纳米管的大小无关,你现在是要算单独的一个分子具有的能量,只要你取的晶胞大点,保证计算出来的能量是单个分子的就行(晶胞选得大点,保证周期性的情况下,其它相邻的分子与你算的分子没有相互作用)了。
正常来说的话,选取碳纳米管大小也足够了,因为CNT晶胞的大小我们也是测试出来的。可以保证超晶胞中相邻两个分子之间没有相互作用。
我用的是VASP,因为在VASP里计算能量必须用周期性结构,计算单个分子也只能通过空位层来解决。我不太了解你用的软件,如果DMOL软件计算能量也是用周期结构的话就是我上面说得,如果可以计算单个分子的能量就请高师们指点一下吧。
7楼2010-11-18 11:11:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wanfei 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 2026年国自然面上资助率 +15 布布和一二 2026-07-30 19/950 2026-08-01 15:18 by 40862026
[基金申请] 面上再次挂了,太难了,躺也躺不了,倦也卷不过,小学校之殇! +15 低垂的野花 2026-07-31 20/1000 2026-08-01 14:10 by gltch
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 jzg3xk1po8 2026-07-31 8/400 2026-08-01 13:53 by y4XuShGyllvT
[考博] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 jzg3xk1po8 2026-07-31 10/500 2026-08-01 13:51 by y4XuShGyllvT
[基金申请] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 jzg3xk1po8 2026-07-31 10/500 2026-08-01 13:51 by y4XuShGyllvT
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 jzg3xk1po8 2026-07-31 7/350 2026-08-01 13:49 by y4XuShGyllvT
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 jzg3xk1po8 2026-07-31 10/500 2026-08-01 13:49 by y4XuShGyllvT
[基金申请] 小木虫看见有人已经知道结果了 +16 1234567wang 2026-07-25 20/1000 2026-08-01 08:57 by type2type
[教师之家] 基础研究怎么拉横向,学校到款任务越来越多,难以完成 拉横向,都有哪些途径啊 +8 锦衣卫寒战 2026-07-28 8/400 2026-07-31 18:13 by beefly
[高分子] HXDI做水性聚氨酯乳液,是不是特别容易出渣 15+3 yuyusuv 2026-07-29 3/150 2026-07-31 09:21 by huizingga
[基金申请] 系统今天又提示维护了,估计离放榜不远了 +11 winnerche 2026-07-29 15/750 2026-07-30 23:08 by jnhyjjm
[基金申请] 你们的时间戳变了吗 +3 archvillain 2026-07-30 4/200 2026-07-30 18:53 by levinzhwen
[基金申请] 今年的WR进展到哪一步了? +5 wsgjhwz 2026-07-25 9/450 2026-07-30 12:59 by 可淡不可忘
[有机交流] 产物和副产物价值比较 30+4 小汤02 2026-07-27 5/250 2026-07-30 12:44 by czyzsu
[基金申请] 时间戳他又来了 +14 晓晓爱翠翠 2026-07-26 17/850 2026-07-29 16:30 by 呵呵二哥
[有机交流] 这个自发加氧反应的机理是什么? 50+4 YUAN2273 2026-07-25 7/350 2026-07-29 12:27 by xiaobenpu
[基金申请] 这种情况还有戏吗 +5 drbart 2026-07-27 11/550 2026-07-29 05:50 by drbart
[基金申请] 同事接到电话了,我却没有 +4 1234567wang 2026-07-27 4/200 2026-07-28 10:11 by GOODLUCKER
[基金申请] 准备明年的基金了 +5 Tide man 2026-07-27 5/250 2026-07-28 09:25 by newfuzzy1
[分析] 水蒸气蒸馏法乳化现象 +3 月光娇娇 2026-07-26 3/150 2026-07-26 23:25 by caiyun
信息提示
请填处理意见