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【求助】纳米管问题
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各位高手: 我现在在算药物分子与纳米管相互作用,纳米管算的时候用的是超晶包,药物-纳米管复合物也是超晶包,那么单独的药物分子计算时也需要把药物分子放在超晶包中计算吗?我看文献上算气体分子在纳米材料上吸附时,纳米管,纳米管-气体分子复合物都是放在晶包里算的,可是单独的气体分子没有放在晶包中。那么到底需不需要放啊?因为如果不放它就是非周期的,而其它的建了晶包的是周期性的啊。希望高手指点下,谢谢! |
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2楼2010-11-16 23:14:16
3楼2010-11-17 17:42:10
4楼2010-11-17 23:02:27
5楼2010-11-17 23:05:25
6楼2010-11-18 09:57:35
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youzhizhe(金币+2):谢谢交流。 2010-11-18 11:17:15
zzy870720z(金币+2):谢谢交流 2010-11-18 11:59:14
wanfei(金币+1):谢谢 2010-11-18 17:55:26
youzhizhe(金币+2):谢谢交流。 2010-11-18 11:17:15
zzy870720z(金币+2):谢谢交流 2010-11-18 11:59:14
wanfei(金币+1):谢谢 2010-11-18 17:55:26
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我也是做CTN的。 看样子你是想先把结合起来的E算出来,再把单独的算出来,然后相减来算它们的结合能吧,这样的话,你在计算单独(也就是分开的时候单个的)能量时,各自考虑各自的。晶胞的大小与碳纳米管的大小无关,你现在是要算单独的一个分子具有的能量,只要你取的晶胞大点,保证计算出来的能量是单个分子的就行(晶胞选得大点,保证周期性的情况下,其它相邻的分子与你算的分子没有相互作用)了。 正常来说的话,选取碳纳米管大小也足够了,因为CNT晶胞的大小我们也是测试出来的。可以保证超晶胞中相邻两个分子之间没有相互作用。 我用的是VASP,因为在VASP里计算能量必须用周期性结构,计算单个分子也只能通过空位层来解决。我不太了解你用的软件,如果DMOL软件计算能量也是用周期结构的话就是我上面说得,如果可以计算单个分子的能量就请高师们指点一下吧。 |
7楼2010-11-18 11:11:50










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