| 查看: 1276 | 回复: 10 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
043114076木虫 (正式写手)
|
[交流]
【讨论】towhee 运算极其的慢 已有3人参与
|
||
|
使用towhee进行了离子液体NVT模拟，体系有6000多个原子，发现运行速度特别的慢。查看了所有原因，最后认为是towhee 没有使用 neighbor list，每一步都要从新计算能量。 在towhee的论坛里有人在2004年建议加入neighbor list，给出的回复是正在加入（is being implemented），其中有人说使用neighbor list可能会导致list 更新过于频繁反而是模拟变得更慢，这也是有可能的。 查看了ghcacj版主写的Music教程，发现Music使用了map方法，极大的加速了模拟过程。现在决定放弃towhee 尝试music。 |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有5人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有5人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有6人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
小木虫上这么多卖论文的，真有人买论文么？感觉没必要啊
已经有12人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
各位道友，我要去昆明玩几天，回来见。
已经有8人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 抽滤很慢要等几天 请问大家有什么小窍门没有？
已经有16人回复
- 薄膜热处理的升温速率与TG曲线失重快慢的关系
已经有3人回复
- 国外的导师回复邮件是有多慢
已经有15人回复
- RAW264.7细胞长得很慢吗？
已经有12人回复
- 【分享】VOA SE.WordBook.v2009--听懂VOA慢速英语单词必备【已搜索无重复】
已经有112人回复
- 【求助】求助裸鼠移植瘤生长慢
已经有3人回复
- vista系统中word2003和origin8运行奇慢
已经有16人回复
- 巨慢 Advances in Polymer Technology
已经有7人回复
8楼2010-11-17 11:28:55
ghcacj
荣誉版主 (著名写手)
阿超
- 模拟EPI: 16
- 应助: 26 (小学生)
- 贵宾: 2.764
- 金币: 2543.5
- 散金: 8899
- 红花: 35
- 沙发: 3
- 帖子: 1376
- 在线: 1199小时
- 虫号: 513281
- 注册: 2008-02-27
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 分子模拟
2楼2010-11-16 16:46:02
043114076
木虫 (正式写手)
- 应助: 49 (小学生)
- 金币: 3364.9
- 散金: 52
- 红花: 23
- 帖子: 788
- 在线: 369.5小时
- 虫号: 570592
- 注册: 2008-06-07
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
3楼2010-11-16 17:05:51
4楼2010-11-16 20:27:37
