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tiechong

金虫 (著名写手)

[交流] 【调查】大家又没有碰到过文献里报道的结果重复不出来的情况 已有8人参与

最近优化一些分子,international journal of quantum chemistry 2005年和Journal of Molecular Graphics and Modelling 2010年里分别报道过其中几个分子优化的构型,不过我算来算去都跟这些人不大一样,即使我把初始构型调的跟他们差不多最后也还是跑到我自己的构型来了,

如果以后写在文章里的话, 该怎么解释这种情况比较合理,直接说我跟XX以及XX不一样嘛
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ykwang

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by tiechong at 2010-11-14 06:01:00:


最大误差达到1A啦,不知道是咋回事

比如我算了是个平面分子,文章里说是个扭曲了的,而且偏离平面达到1A了

1. 多大的分子?如果是平面分子且尺度很大,那么计算结果会发现平面有所弯曲,原因在于通常的计算中没有考虑远程作用。
2. 计算中包含不包含溶剂效应?Gaussian09中溶剂参数与03不同,因此包含溶剂效应时两者的优化结果会有较大差别。
3. 如有怀疑,还是建议用Gaussian03来重复文献的结果。

[ Last edited by ykwang on 2010-11-14 at 06:25 ]
Nothing_Is_Impossible!
10楼2010-11-14 06:11:22
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
用的软件和软件版本是否一样,如果不一样,结果很大程度上不一样。
Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
2楼2010-11-12 23:14:20
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heyo_123

至尊木虫 (职业作家)

引用回帖:
Originally posted by tiechong at 2010-11-12 22:51:11:
最近优化一些分子,international journal of quantum chemistry 2005年和Journal of Molecular Graphics and Modelling 2010年里分别报道过其中几个分子优化的构型,不过我算来算去都跟这些人不大一样,即使我把 ...

肯定有了!
3楼2010-11-13 14:32:19
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ykwang

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
没有遇到过你说的情况。差别当然会有的,但不可能很明显,否则你完全可以向作者讨个说法。
Nothing_Is_Impossible!
4楼2010-11-13 14:41:59
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