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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 其他 » 【调查】大家又没有碰到过文献里报道的结果重复不出来的情况
汕头大学海洋科学接受调剂
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tiechong

金虫 (著名写手)

[交流] 【调查】大家又没有碰到过文献里报道的结果重复不出来的情况 已有8人参与

最近优化一些分子，international journal of quantum chemistry 2005年和Journal of Molecular Graphics and Modelling 2010年里分别报道过其中几个分子优化的构型，不过我算来算去都跟这些人不大一样，即使我把初始构型调的跟他们差不多最后也还是跑到我自己的构型来了，

如果以后写在文章里的话， 该怎么解释这种情况比较合理，直接说我跟XX以及XX不一样嘛
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1楼 2010-11-12 22:51:11
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
用的软件和软件版本是否一样，如果不一样，结果很大程度上不一样。
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Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
2楼2010-11-12 23:14:20
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heyo_123

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
Originally posted by tiechong at 2010-11-12 22:51:11:
最近优化一些分子，international journal of quantum chemistry 2005年和Journal of Molecular Graphics and Modelling 2010年里分别报道过其中几个分子优化的构型，不过我算来算去都跟这些人不大一样，即使我把 ...

肯定有了！
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3楼2010-11-13 14:32:19
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ykwang

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
没有遇到过你说的情况。差别当然会有的，但不可能很明显，否则你完全可以向作者讨个说法。
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Nothing_Is_Impossible!
4楼2010-11-13 14:41:59
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dg0222076

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
如果作者不是中国人，尤其欧美人一般科研态度较认真，结果错误可能性小，检查自己是否出错。
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5楼2010-11-13 14:51:31
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manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人
引用回帖:
Originally posted by dg0222076 at 2010-11-13 14:51:31:
如果作者不是中国人，尤其欧美人一般科研态度较认真，结果错误可能性小，检查自己是否出错。

中国的这么不靠谱啊。
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惺惺相惜情不自禁
6楼2010-11-13 15:21:32
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tiechong

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by qzhaosdu at 2010-11-12 23:14:20:
用的软件和软件版本是否一样，如果不一样，结果很大程度上不一样。

俺用的是gaussian 09，文章里写的是gaussian 03, 这个应该不至于导致太大的差别吧
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7楼2010-11-14 05:57:56
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tiechong

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by heyo_123 at 2010-11-13 14:32:19:

肯定有了！

肯定有啥？
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8楼2010-11-14 05:58:32
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tiechong

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by ykwang at 2010-11-13 14:41:59:
没有遇到过你说的情况。差别当然会有的，但不可能很明显，否则你完全可以向作者讨个说法。

最大误差达到1A啦，不知道是咋回事

比如我算了是个平面分子，文章里说是个扭曲了的，而且偏离平面达到1A了
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9楼2010-11-14 06:01:00
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ykwang

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by tiechong at 2010-11-14 06:01:00:


最大误差达到1A啦，不知道是咋回事

比如我算了是个平面分子，文章里说是个扭曲了的，而且偏离平面达到1A了

1. 多大的分子？如果是平面分子且尺度很大，那么计算结果会发现平面有所弯曲，原因在于通常的计算中没有考虑远程作用。
2. 计算中包含不包含溶剂效应？Gaussian09中溶剂参数与03不同，因此包含溶剂效应时两者的优化结果会有较大差别。
3. 如有怀疑，还是建议用Gaussian03来重复文献的结果。

[ Last edited by ykwang on 2010-11-14 at 06:25 ]
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Nothing_Is_Impossible!
10楼2010-11-14 06:11:22
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