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xjxj1xjxj

银虫 (著名写手)


[交流] 【求助】水滑石(LDH,Layered double hydroxide)用MS模拟时的分数坐标

紧急求助 水滑石(LDH,Layered double hydroxide)用MS模拟时的分数坐标
Mg、 Al、 O、 H、在用MS软件模拟时所用到的分数坐标 分别是多少
万分感谢!
LDH R3m群 166  正八面体
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★ ★ ★
xjxj1xjxj(金币+10): 2010-11-13 15:56:54
youzhizhe(金币+3):谢谢指导。 2010-11-25 13:02:40
再附上一个cif文件的内容
CODE:
data_82874-ICSD
#?2008 by Fachinformationszentrum Karlsruhe, and the U.S. Secretary of
#Commerce on behalf of the United States.  All rights reserved.
_database_code_ICSD                82874
_audit_creation_date               1998/06/26
_audit_update_record               2008/02/01
_chemical_name_systematic
;
Dialuminium Tetramagnesium Dodecahydroxide Carbonate Trihydrate
;
_chemical_formula_structural       'Al2 Mg4 (O H)12 (C O3) (H2 O)3'
_chemical_formula_sum              'C1 H18 Al2 Mg4 O18'
_chemical_name_mineral             'Quintinite 2H'
_publ_section_title
;
Crystal structure and comparative crystal chemistry of Al2 Mg4 (O
H)12 (C O3). 3(H2 O), a new mineral from the hydrotalcite- manasseite
group
;
loop_
_citation_id
_citation_journal_abbrev
_citation_year
_citation_journal_volume
_citation_journal_issue
_citation_page_first
_citation_page_last
_citation_journal_id_ASTM
primary Kristallografiya 1996 41 6 1024 1034 KRISAJ
2 'American Mineralogist' 1967 52- 1036 1047 AMMIAY
_publ_author_name
;
Arakcheeva, A.V.;Pushcharovskii, D.Yu.;Rastsvetaeva, R.K.;Atencio,
D.;Lubman, G.U.
;
_cell_length_a                     5.283(3)
_cell_length_b                     5.283(3)
_cell_length_c                     15.150(9)
_cell_angle_alpha                  90.
_cell_angle_beta                   90.
_cell_angle_gamma                  120.
_cell_volume                       366.19
_cell_formula_units_Z              1
_symmetry_space_group_name_H-M     'P -6 2 m'
_symmetry_Int_Tables_number        189
_refine_ls_R_factor_all            .039
loop_
_symmetry_equiv_pos_site_id
_symmetry_equiv_pos_as_xyz
  1        '-x, -x+y, -z'
  2        'x-y, -y, -z'
  3        'y, x, -z'
  4        '-x, -x+y, z'
  5        'x-y, -y, z'
  6        'y, x, z'
  7        '-x+y, -x, -z'
  8        '-y, x-y, -z'
  9        'x, y, -z'
10        '-x+y, -x, z'
11        '-y, x-y, z'
12        'x, y, z'
loop_
_atom_type_symbol
_atom_type_oxidation_number
Al3+        3
C4+        4
H1+        1
Mg2+        2
O2-        -2
loop_
_atom_site_label
_atom_site_type_symbol
_atom_site_symmetry_multiplicity
_atom_site_Wyckoff_symbol
_atom_site_fract_x
_atom_site_fract_y
_atom_site_fract_z
_atom_site_occupancy
_atom_site_attached_hydrogens
_atom_site_B_iso_or_equiv
Mg1 Mg2+ 4 h 0.3333 0.6667 0.243(3) 1. 0 1.8(1)
Al1 Al3+ 2 e 0 0 0.259(3) 1. 0 2.6(1)
C1 C4+ 2 e 0 0 0.021(8) 0.5 0 6.3(9)
O1 O2- 6 i 0 0.651(2) 0.325(8) 1. 1 2.9(2)
O2 O2- 6 i 0.318(2) 0 0.190(1) 1. 1 2.7(2)
O3 O2- 3 f 0.244(3) 0 0 1. 0 4.3(6)
O4 O2- 3 g 0.598(5) 0 0.5 1. 2 6.5(8)
H1 H1+ 6 i 0.35(3) 0.35(3) 0.398(9) 1. 0 3.0(8)
H2 H1+ 6 i 0 0.36(3) 0.125(9) 1. 0 3.0(8)
#Position of 6 Elements of H Are Undetermined.
#End of data_82874-ICSD

7楼2010-11-13 08:00:45
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普通回帖

zxzj05(金币+1):奖励! 2010-11-12 22:33:29
xjxj1xjxj(金币+1): 2010-11-13 00:33:08
LDH有很多种吧
你说的太广泛了
最还能再给点详细点材料信息
2楼2010-11-12 15:56:38
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xjxj1xjxj

银虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-11-12 15:56:38:
LDH有很多种吧
你说的太广泛了
最还能再给点详细点材料信息

Mg-Al -CO3 水滑石 Mg:AL=1:2
我也只知道这么多,想用MS画个图 万分感谢!
3楼2010-11-13 00:34:59
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xjxj1xjxj

银虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-11-12 15:56:38:
LDH有很多种吧
你说的太广泛了
最还能再给点详细点材料信息

Mg:Al=1:2;   Mg-Al-CO3型水滑石
非常感谢!
4楼2010-11-13 00:36:38
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xjxj1xjxj

银虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-11-12 15:56:38:
LDH有很多种吧
你说的太广泛了
最还能再给点详细点材料信息

Mg-Al -CO3 水滑石 Mg:AL=2:1  上面写错了 不好意思
我也只知道这么多,想用MS画个图 万分感谢!
本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2587619&pid=2020293&page=1#pid2020293
5楼2010-11-13 00:37:25
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★ ★ ★ ★ ★
mazuju028(金币+2):谢谢交流 2010-11-13 16:06:55
youzhizhe(金币+3):谢谢指导。 2010-11-25 13:02:14
icsd查询里面就这一个很近似的结构
不过关于50%占位的我不会建,你可以发帖求助一下
CODE:
*data for   ICSD #82874
Coll Code   82874
Rec  Date   1998/06/26
Mod  Date   2008/02/01
Chem Name   Dialuminium Tetramagnesium Dodecahydroxide Carbonate Trihydrate
Structured  Al2 Mg4 (O H)12 (C O3) (H2 O)3
Sum         C1 H18 Al2 Mg4 O18
ANX         AB2C4X18
Min Name    Quintinite 2H
D(calc)     2.13
Title       Crystal structure and comparative crystal chemistry of Al2 Mg4 (O
            H)12 (C O3). 3(H2 O), a new mineral from the hydrotalcite- manasseite
            group
Author(s)   Arakcheeva, A.V.;Pushcharovskii, D.Yu.;Rastsvetaeva, R.K.;Atencio,
            D.;Lubman, G.U.
Reference   Kristallografiya
            (1996), 41(6), 1024-1034
            American Mineralogist
            (1967), 52, 1036-1047
Unit Cell   5.283(3) 5.283(3) 15.150(9) 90. 90. 120.
Vol         366.19
Z           1
Space Group P -6 2 m
SG Number   189
Cryst Sys   hexagonal
Pearson     hP43
Wyckoff     i2 h g f e2
R Value     .039
Red Cell    P  5.283 5.283 15.15 90 90 120 366.188
Trans Red   1.000 0.000 0.000 / 0.000 1.000 0.000 / 0.000 0.000 1.000
Comments    R(isotropic)=0.047; 2nd ref. (Ross & Kodama)
            Compound with mineral name: Quintinite 2H
            The structure has been assigned a PDF number (experimental
            powder diffraction data): 51-1528
            X-ray diffraction from single crystal
            Position of 6 Elements of H Are Undetermined.
Atom  #   OX   SITE      x           y           z           SOF      H        ITF(B)   
Mg   1  +2    4 h   0.3333      0.6667      0.243(3)       1.         0          1.8(1)
Al   1  +3    2 e   0           0           0.259(3)       1.         0          2.6(1)
C    1  +4    2 e   0           0           0.021(8)       0.5        0          6.3(9)
O    1  -2    6 i   0           0.651(2)    0.325(8)       1.         H1         2.9(2)
O    2  -2    6 i   0.318(2)    0           0.190(1)       1.         H1         2.7(2)
O    3  -2    3 f   0.244(3)    0           0              1.         0          4.3(6)
O    4  -2    3 g   0.598(5)    0           0.5            1.         H2         6.5(8)
H    1  +1    6 i   0.35(3)     0.35(3)     0.398(9)       1.         0          3.0(8)
H    2  +1    6 i   0           0.36(3)     0.125(9)       1.         0          3.0(8)
*end for    ICSD #82874

6楼2010-11-13 07:59:43
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xjxj1xjxj

银虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-11-13 08:00:45:
再附上一个cif文件的内容

[code]
data_82874-ICSD
#?2008 by Fachinformationszentrum Karlsruhe, and the U.S. Secretary of
#Commerce on behalf of the United States.  All rights reserved.
_databa ...

非常感谢
8楼2010-11-13 15:56:46
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maress

金虫 (小有名气)


太强大了。。。。
9楼2010-11-17 21:37:37
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zyj8119

木虫 (著名写手)



mazuju028(金币+1):谢谢交流 2010-11-24 21:06:29
xjxj1xjxj(金币+2): 您好,请问怎么导入到MS里面? 2011-04-28 20:05:05
引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-11-13 08:00:45:
再附上一个cif文件的内容

[code]
data_82874-ICSD
#?2008 by Fachinformationszentrum Karlsruhe, and the U.S. Secretary of
#Commerce on behalf of the United States.  All rights reserved.
_databa ...

把此文件保存,然后导入MS就可以了。。。
10楼2010-11-24 20:16:59
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引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-11-13 08:00:45:
再附上一个cif文件的内容

[code]
data_82874-ICSD
#?2008 by Fachinformationszentrum Karlsruhe, and the U.S. Secretary of
#Commerce on behalf of the United States.  All rights reserved.
_databa ...

这个可以用在vasp中?
11楼2010-11-24 20:48:43
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cenwanglai(金币+1):谢谢回复! 2010-11-25 09:08:14
引用回帖:
Originally posted by cenwanglai at 2010-11-24 20:48:43:



这个可以用在vasp中?

不能
这个没有经过对称性变换
如果你计算的话会少很多对称性的原子
12楼2010-11-24 22:43:15
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相识在一月

金虫 (小有名气)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by maress at 2010-11-17 21:37:37:
太强大了。。。。

你好,我想请问下,要保存成什么格式,然后导入MS中?谢谢指导。
13楼2011-06-09 19:13:48
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★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-06-09 19:24:32
引用回帖:
Originally posted by 相识在一月 at 2011-06-09 19:13:48:
你好,我想请问下,要保存成什么格式,然后导入MS中?谢谢指导。

cif格式,存在英文路径下直接导入。
14楼2011-06-09 19:23:04
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piaocjj

木虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by cenwanglai at 2011-06-09 19:23:04:
cif格式,存在英文路径下直接导入。

感激不尽
15楼2011-06-10 10:55:53
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