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hujingchun

金虫 (小有名气)

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虫号: 625216

[交流] 【交流】有关氢键的，请指正

在 .lst 中
Specified hydrogen bonds (with esds except fixed and riding H)

  D-H       H...A       D...A       <(DHA)

** No suitable H-bond found for N3...N5 = 7.185(4) A **
  0.86       1.96       2.807(3)    166.3       N3-H3A...N8_$1
  0.86       1.99       2.731(3)    144.3       N5-H5A...O1_$2

Hydrogen bonds with  H..A < r(A) + 2.000 Angstroms  and   110 deg.

D-H          d(D-H) d(H..A)
N3-H3A       0.860 1.963 166.30 2.807 N8 [ x, y+1, z ]

N5-H5A       0.860 1.986 144.29 2.731 O1 [ -x, -y, -z ]

在 .cif 中是这样的

loop_
_symmetry_equiv_pos_as_xyz
'x, y, z'
'-x, -y, -z'

loop_
_geom_hbond_atom_site_label_D
_geom_hbond_atom_site_label_H
_geom_hbond_atom_site_label_A
_geom_hbond_distance_DH
_geom_hbond_distance_HA
_geom_hbond_distance_DA
_geom_hbond_angle_DHA
_geom_hbond_site_symmetry_A
N3 H3A N8  0.86 1.96 2.807(3) 166.3 1_565
N5 H5A O1  0.86 1.99 2.731(3) 144.3 2

请问虫友们，这两个文件里表达的氢键是一个意思吗？
我准备投 ACTA-e的，
谢谢指教

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