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guojingya

银虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】测序问题请教，希望大家给予帮助！谢谢

各位虫友们，我想请问大家:
我最近克隆了一段基因序列，连19T-载体后，送测序（测通），比对结果发现在合成的引物部位缺少两个碱基，其他序列都正确。我不知道是引物合成的时候公司给合成错了  还是测序的时候他们测的不准确？希望大家给予意见。谢谢大家了！
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1楼 2010-11-02 16:39:26
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hyy2005bne

新虫 (小有名气)
★
guojingya(金币+1):谢谢参与
guojingya(金币+5): 2010-11-03 09:38:28
我觉得你可以和测序公司的联系一下，问问他们是怎么回事。我用过pMD-19T载体，没有出现这种情况。
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4楼2010-11-02 21:57:30
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randomqd

木虫 (小有名气)

樱花骑士

建议再测一次

★
guojingya(金币+6): 2010-11-02 19:04:54
scelab(金币+1):热心虫友，欢迎多来交流~~~:tiger06::tiger28::tiger23: 2010-11-02 23:30:25
出错的序列是否有复杂结构。比如发夹？
如有发夹应在测序的时候备注。
出错的序列是否离测序引物较近？
大家都知道测序引物较近的序列不容易测出来。或者可以重新设计个远一点测序引物
合成引物的单子拿出来看一下，当时是否有填错？
你测了几个？
如果只测了一个，那建议你再测两三个。
祝好
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未来天空才是极限
2楼2010-11-02 17:46:26
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guojingya

银虫 (初入文坛)
非常感谢你的回答。我是直接连的pMD-19T载体，他们用通用引物测的序，我没有提供引物。我想请问下，引物合成公司不会把引物序列合成错吧（他们给我引物合成单是正确的）。再次感谢你！
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3楼2010-11-02 19:09:51
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