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guojingya

银虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】测序问题请教,希望大家给予帮助!谢谢

各位虫友们,我想请问大家:
我最近克隆了一段基因序列,连19T-载体后,送测序(测通),比对结果发现在合成的引物部位缺少两个碱基,其他序列都正确。我不知道是引物合成的时候公司给合成错了  还是测序的时候他们测的不准确?希望大家给予意见。谢谢大家了!
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randomqd

木虫 (小有名气)

樱花骑士

建议再测一次

★
guojingya(金币+6): 2010-11-02 19:04:54
scelab(金币+1):热心虫友,欢迎多来交流~~~:tiger06::tiger28::tiger23: 2010-11-02 23:30:25
出错的序列是否有复杂结构。比如发夹?
如有发夹应在测序的时候备注。
出错的序列是否离测序引物较近?
大家都知道测序引物较近的序列不容易测出来。或者可以重新设计个远一点测序引物
合成引物的单子拿出来看一下,当时是否有填错?
你测了几个?
如果只测了一个,那建议你再测两三个。
祝好
未来天空才是极限
2楼2010-11-02 17:46:26
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guojingya

银虫 (初入文坛)

非常感谢你的回答。我是直接连的pMD-19T载体,他们用通用引物测的序,我没有提供引物。我想请问下,引物合成公司不会把引物序列合成错吧(他们给我引物合成单是正确的)。再次感谢你!
3楼2010-11-02 19:09:51
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hyy2005bne

新虫 (小有名气)

★
guojingya(金币+1):谢谢参与
guojingya(金币+5): 2010-11-03 09:38:28
我觉得你可以和测序公司的联系一下,问问他们是怎么回事。我用过pMD-19T载体,没有出现这种情况。
4楼2010-11-02 21:57:30
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