24小时热门版块排行榜    

查看: 3982  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

vip_zzc

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】(请教!!)如何在VMD中对结构图形中的特定残基进行标记?? 已有4人参与

图片我也不知道怎么在帖子中显示,那就口述好了.
CODE:

对结构图形中的指定残基在其附近标记出来:
如 LYS11  ARG12   RA3  DC 18 ....

在VMD中怎么才能实现呢?????? 谢谢....
回复此楼
路漫漫长其修远兮,吾将上下而求索~
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sjnyongle

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+5):谢谢 2010-11-16 14:02:59
在VMD里面,你可以这样做:
Mouse--Lable-atoms(以PHE49:CD1为例)
然后到:
Graphics-Lables-选中标记的原子PHE48:CD1, 然后“Properties”-'Format'(%R%d:%a),然后删除“%a”, Format
变成“%R%d”. 这是在openGL,则显示为,PHE48
希望有帮到你!

[ Last edited by sjnyongle on 2010-11-15 at 15:11 ]
4楼2010-11-15 15:09:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

xulinan

木虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-11-05 12:02:42
主菜单 mouse——label 可以选一种你需要标记的方法,包括键长键角都能显示,不知道你需要的是不是这个
2楼2010-11-02 12:29:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

vip_zzc

铜虫 (小有名气)

这个我试过,只能显示单个原子及键长信息。

我说的是针对单个残基的。。

e.g. AGR11  RA12 etc. ,  labeled like this.

我研究过应该不行的,师兄说他一般都是PS上的。。

不知道其它虫友有没有别的妙招呢。。。
路漫漫长其修远兮,吾将上下而求索~
3楼2010-11-05 11:19:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

vip_zzc

铜虫 (小有名气)

谢谢。。

引用回帖:
Originally posted by sjnyongle at 2010-11-15 15:09:03:
在VMD里面,你可以这样做:
Mouse--Lable-atoms(以PHE49:CD1为例)
然后到:
Graphics-Lables-选中标记的原子PHE48:CD1, 然后“Properties”-'Format'(%R%d:%a),然后删除“%a”, Format
变成“%R%d”. 这是 ...

我试了一下,真的还可以的。。只是不能改变颜色,默认都是GREEN的。
路漫漫长其修远兮,吾将上下而求索~
5楼2010-11-16 19:05:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +8 majunge000 2026-08-10 9/450 2026-08-12 22:17 by 虫友是什么虫
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +10 Tide man 2026-08-11 10/500 2026-08-12 20:59 by 陈晨晨陈啊
[论文投稿] 职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊 +4 工厂打螺丝 2026-08-08 4/200 2026-08-12 09:18 by hansi2025
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +7 布布和一二 2026-08-10 10/500 2026-08-12 09:12 by 布布和一二
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +3 majunge000 2026-08-11 4/200 2026-08-11 20:13 by lch2012
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 静等基金结果 +5 gjjjzhong 2026-08-10 16/800 2026-08-10 17:19 by Tide man
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
信息提示
请填处理意见