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vip_zzc

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】(请教!!)如何在VMD中对结构图形中的特定残基进行标记?? 已有4人参与

图片我也不知道怎么在帖子中显示,那就口述好了.
CODE:

对结构图形中的指定残基在其附近标记出来:
如 LYS11  ARG12   RA3  DC 18 ....

在VMD中怎么才能实现呢?????? 谢谢....
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路漫漫长其修远兮,吾将上下而求索~
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sjnyongle

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+5):谢谢 2010-11-16 14:02:59
在VMD里面,你可以这样做:
Mouse--Lable-atoms(以PHE49:CD1为例)
然后到:
Graphics-Lables-选中标记的原子PHE48:CD1, 然后“Properties”-'Format'(%R%d:%a),然后删除“%a”, Format
变成“%R%d”. 这是在openGL,则显示为,PHE48
希望有帮到你!

[ Last edited by sjnyongle on 2010-11-15 at 15:11 ]
4楼2010-11-15 15:09:03
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xulinan

木虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-11-05 12:02:42
主菜单 mouse——label 可以选一种你需要标记的方法,包括键长键角都能显示,不知道你需要的是不是这个
2楼2010-11-02 12:29:51
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vip_zzc

铜虫 (小有名气)

这个我试过,只能显示单个原子及键长信息。

我说的是针对单个残基的。。

e.g. AGR11  RA12 etc. ,  labeled like this.

我研究过应该不行的,师兄说他一般都是PS上的。。

不知道其它虫友有没有别的妙招呢。。。
路漫漫长其修远兮,吾将上下而求索~
3楼2010-11-05 11:19:35
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vip_zzc

铜虫 (小有名气)

谢谢。。

引用回帖:
Originally posted by sjnyongle at 2010-11-15 15:09:03:
在VMD里面,你可以这样做:
Mouse--Lable-atoms(以PHE49:CD1为例)
然后到:
Graphics-Lables-选中标记的原子PHE48:CD1, 然后“Properties”-'Format'(%R%d:%a),然后删除“%a”, Format
变成“%R%d”. 这是 ...

我试了一下,真的还可以的。。只是不能改变颜色,默认都是GREEN的。
路漫漫长其修远兮,吾将上下而求索~
5楼2010-11-16 19:05:43
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