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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 【求助】如何对CCDC下载的晶体结构理论加氢
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gtolv8688

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】如何对CCDC下载的晶体结构理论加氢 已有1人参与

我是做MOF吸附的，从CCDC中下载了MOF-9的cif文件，导入到MS中发现没有加氢。我在小木虫上搜索了一下，好像用Xshell可以理论加氢，我下载了Xshell6.3.1并导入了cif文件，结果发现只显示一个原子，右键Show all atoms也不管用。我又重新从CCDC中导出了res文件，这次看到了一个很乱的结构，键连得乱七八糟的。右键选择加氢，结果加完更乱了。请教熟悉晶体解析的高手们我要怎么做才能正确地为我的结构加上氢啊？有没有加化学键的命令啊？
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Livewithproblem！
1楼 2010-10-29 16:34:48
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
Originally posted by gtolv8688 at 2010-10-29 21:21:51:


那请问我将cif文件导入xshell后只能显示一个原子，这个是什么原因呢？还有可以单独安装xshell吗？还是必须安装shextl，然后再安装Xshell？我刚刚学习这个，很多都不懂啊

可能有些cif不规范。 所以导入时显示不正确。
你可以把cif上载上来，大家看看。
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xi2004-emuch@163.com
7楼2010-10-29 22:53:36
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yunruirui

荣誉版主 (著名写手)

Alchemist
gtolv8688(金币+1):谢谢热心回复！ 2010-10-29 21:22:14
帝夫:感谢您的回复！ 2010-10-29 22:24:29
你可以在shextl里面的xshell理论加氢，也可以是用Hfix在INS中加氢，或者XP中加氢，具体加氢方法可以参考晶体结构解析这本书当当网有卖
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2楼2010-10-29 19:28:05
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juzi121

金虫 (正式写手)
gtolv8688(金币+1):谢谢热心回复！ 2010-10-29 21:22:34
帝夫:感谢您的回复！ 2010-10-29 22:24:42
shextl
里面可以加氢的只要不是水上的氢，就可以输入hadd命令，水上通过Q加氢
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简简单单，活在自己幸福的世界里，幸运的是一直有好多的人关心我疼爱我
3楼2010-10-29 19:48:15
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gtolv8688

铜虫 (小有名气)
帝夫:感谢您的回复！ 2010-10-29 22:25:03
引用回帖:
Originally posted by yunruirui at 2010-10-29 19:28:05:
你可以在shextl里面的xshell理论加氢，也可以是用Hfix在INS中加氢，或者XP中加氢，具体加氢方法可以参考晶体结构解析这本书当当网有卖

那请问我将cif文件导入xshell后只能显示一个原子，这个是什么原因呢？还有可以单独安装xshell吗？还是必须安装shextl，然后再安装Xshell？我刚刚学习这个，很多都不懂啊
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Livewithproblem！
4楼2010-10-29 21:21:51
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