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heyo_123

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 【求助】审稿人意见,不是很懂,大家帮帮忙!


1.“I suggest that the authors include the clarifications for the basis set superposition error(BSSE) calculations in the manuscript.”  这句怎么理解??

2.分子内的BSSE,怎么做,看了几篇文献,还是不会,望高手们指点。


[ Last edited by heyo_123 on 2010-10-27 at 15:05 ]
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ykwang

金虫 (正式写手)

heyo_123(金币+2):谢谢!! 2010-10-28 09:28:04
引用回帖:
Originally posted by hakuna at 2010-10-27 17:05:27:


标准的教科书式的答案。

不用G,所以没有体会;想知道的是:
1.“合适的基组”指什么?“合适”的标准是什么?计算E(A)、E(B)、E(AB)时可以采用不同基组吗?

2.“再用计算AB的基组分别计算AB中的片段A ...

关于“合适的基组”并没有绝对标准,要根据具体的分子来评价。但在计算E(A)、E(B)、E(AB)时是可以采用不同基组的,前提是尽可能保证各自的计算误差均在可接受的范围内(关于这一点,也没有绝对标准)。事实上,A和B可能差别很大而不可能采用同样的基组。例如,B中含有重原子(需要混合赝势基组)而A不含重原子(可以采用较大的全电子基组),或者B中含有O、N等具有孤对电子的原子(需要较大的基组描述)而A不含这类原子(没有必要用大基组),我们可以用不同的基组来分别计算它们的构型和能量。
Nothing_Is_Impossible!
17楼2010-10-27 17:34:50
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查看全部 22 个回答

Joannaouc

木虫 (著名写手)

heyo_123(金币+1):谢了! 2010-10-26 14:27:21
是不是软件里面有相关的选项啊?
2楼2010-10-26 14:26:14
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


heyo_123(金币+5):能给几个例子吗??我看了好多,就是不知道该怎么做! 2010-10-26 14:48:31
分子内BSSE需要把分子在适当位置进行切割成为2个分子片段后再进行常规BSSE校正处理。注意要让涉及到分子内BSSE的区域仍然保持原来的相对位置不动,而通过调整构型让两个片段中的与BSSE不相关的区域尽量远离。切割点需要进行饱和处理(比如加氢)。
3楼2010-10-26 14:42:52
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)

heyo_123(金币+5):谢谢!!能给几个例子吗》??? 2010-10-26 14:49:12
楼主去查下Sławomir J. Grabowski这个人的文章,他做了好多分子内氢键的BSSE计算。
Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
5楼2010-10-26 14:45:42
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