24小时热门版块排行榜    

查看: 2344  |  回复: 14
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

gql119

铜虫 (小有名气)

[交流] 【其他】autodock 保存文件

大家好,十分感谢之前问题的共同讨论。现在我的autodock已经做到保存结构了,但在windows系统下ADT界面中用File-Save-Write PDB(或Write PDBQT)都出现对话框,提示当前界面的分子数多于一个,不能保存。请教如何在ADT中同时保存配体和受体的PDB文件,我做的十个结构能一起保存下来吗?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caixin5120

木虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by petersen at 2010-12-10 10:16:58:

我还有一个办法:
把你想要的配体结构保存为pdb结构,这样你就不会有多余两个的什么的提示了,然后你把配体的坐标复制到你原来大分子pdb结构坐标的末尾,以TER隔开并以TER结尾,这样你就得到复合物的pdb结构了 ...

不知道这样行不,我用sybyl把配体提取出来后想要merge回去都是不行的,会有问题。如果你的方法可行那就太好了:)
11楼2010-12-10 13:07:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答

gaoqunqunl

金虫 (小有名气)

楼主,我也一直在找这个问题的答案,期待高手帮忙解决!跪谢了
2楼2010-10-17 10:19:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

viger87

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
ghcacj(金币+5):谢谢 2010-10-27 11:50:48
gql119(金币+1):xiexie O(∩_∩)O谢谢 2010-11-22 18:51:58
1.

2.

3.
Write Complex



OK!
有花堪折直须折,末待花落空折枝!
3楼2010-10-27 09:26:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

我芹菜

铜虫 (小有名气)

为什么我只看到“Write Complex,OK”,请教楼上内容。。。
我在过马路,你人在哪里。。。
4楼2010-10-27 16:24:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见