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gql119

铜虫 (小有名气)

[交流] 【其他】autodock 保存文件

大家好，十分感谢之前问题的共同讨论。现在我的autodock已经做到保存结构了，但在windows系统下ADT界面中用File-Save-Write PDB(或Write PDBQT）都出现对话框，提示当前界面的分子数多于一个，不能保存。请教如何在ADT中同时保存配体和受体的PDB文件，我做的十个结构能一起保存下来吗？
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1楼2010-10-16 14:07:50
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caixin5120

木虫 (正式写手)
★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-12-10 10:35:59
引用回帖:
Originally posted by zh1987hs at 2010-10-28 08:07:59:

提示当前页面的分子数多于一个时，你应该看看底下显示配体和受体的提示框里有几个配体，如果多于一个，把多的哪些delete就可以了，如果要保存所有构象，点击write all就可以了

小周说的是正确的，因为你的adt里面分子多了，删除多余的，就可以保存了：） 还有给图的童鞋也是完全正确的，而且是更简单的做法！
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9楼2010-12-10 01:17:27
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caixin5120

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by petersen at 2010-12-10 10:16:58:

我还有一个办法：
把你想要的配体结构保存为pdb结构，这样你就不会有多余两个的什么的提示了，然后你把配体的坐标复制到你原来大分子pdb结构坐标的末尾，以TER隔开并以TER结尾，这样你就得到复合物的pdb结构了 ...

不知道这样行不，我用sybyl把配体提取出来后想要merge回去都是不行的，会有问题。如果你的方法可行那就太好了：）
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11楼2010-12-10 13:07:21
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