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nkxiaowu

金虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】高斯安装后多用户使用、多核运行及服务器配置问题

系统配置：i7-920，12G内存
操作系统：CentOS 5.5
Gaussian版本：EM64T-G03RevE.01（论坛内下载）

先说安装
完全参考版内高手的指点安装，参考帖子地址：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1221940
如此安装之后（我使用DFT01用户安装），其他用户（如DFT02）或者用户组（如DFT用户组）如何使用高斯呢？
也参考了版内其他人的一些安装过程
譬如给g03文件夹授权等
但是均没有成功
麻烦高手帮忙

ps：这一过程害我重新安装系统5遍，因为把几个用户的.bashrc文件、文件夹访问权限等改来改去，最后弄得第一个用户也用不了了。由于本人是首次接触Linux系统，所以麻烦高手们在解答的时候尽量详细些，多谢

再说使用的问题
由于i7-920使用超线程技术，所以系统显示有8核
使用不同的内核数目对一个16C、38H、2N的分子进行优化（主要为了测试执行效率）
mem=10G，b3lyp/6-31g*

nproc=1 CPU时间为6.8h，实际时间6.8h，体系能量-663.2214742
      =4 CPU时间为10.2h，  实际时间3h，体系能量-663.2214665
      =6 CPU时间为28h，    优化失败          体系能量-663.221466520（前两项收敛）
      =7 CPU时间为16.2h，实际时间3h，体系能量-663.2214718

虽然我明白由于另外四核是虚拟出来的，所以在nproc>4的时候没有效果，但是为什么优化后的能量也不相同？有时候还会优化失败呢？有没有人碰到过这种问题？

另外：听说对于具有超线程技术的CPU，可以在主板上关掉超线程，有没有人关过？

最后，想配一台服务器进行计算，大概配置如下：
CPU：intel Xeon X5650*2
内存：金士顿4G 1333*12
硬盘：ST SAS 450G
主板：intel S5520SC （网上看参数，只支持SATA II硬盘接口，是真的么？）
选用机架式，以便以后组集群，请高手给出修改建议！

本人问题比较多，但金币不多，都是每天点击得来的，只能拿出100来，请不要嫌少。
ps：我也想多拿出一些金币，但是版内好多文章都要求金币>500才能看，所以没有办法啊。建议修改一下这种帖子，改成金币>500或者给本版贡献N（N<50)个金币也能看

[ Last edited by nkxiaowu on 2010-10-14 at 09:13 ]

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