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nkxiaowu金虫 (小有名气)
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[交流]
【求助】高斯安装后多用户使用、多核运行及服务器配置问题
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系统配置：i7-920，12G内存 操作系统：CentOS 5.5 Gaussian版本：EM64T-G03RevE.01（论坛内下载） 先说安装 完全参考版内高手的指点安装，参考帖子地址：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1221940 如此安装之后（我使用DFT01用户安装），其他用户（如DFT02）或者用户组（如DFT用户组）如何使用高斯呢？ 也参考了版内其他人的一些安装过程 譬如给g03文件夹授权等 但是均没有成功 麻烦高手帮忙 ps：这一过程害我重新安装系统5遍，因为把几个用户的.bashrc文件、文件夹访问权限等改来改去，最后弄得第一个用户也用不了了。由于本人是首次接触Linux系统，所以麻烦高手们在解答的时候尽量详细些，多谢 再说使用的问题 由于i7-920使用超线程技术，所以系统显示有8核 使用不同的内核数目对一个16C、38H、2N的分子进行优化（主要为了测试执行效率） mem=10G，b3lyp/6-31g* nproc=1 CPU时间为6.8h， 实际时间6.8h，体系能量-663.2214742 =4 CPU时间为10.2h， 实际时间3h， 体系能量-663.2214665 =6 CPU时间为28h， 优化失败 体系能量-663.221466520（前两项收敛） =7 CPU时间为16.2h， 实际时间3h， 体系能量-663.2214718 虽然我明白由于另外四核是虚拟出来的，所以在nproc>4的时候没有效果，但是为什么优化后的能量也不相同？有时候还会优化失败呢？有没有人碰到过这种问题？ 另外：听说对于具有超线程技术的CPU，可以在主板上关掉超线程，有没有人关过？ 最后，想配一台服务器进行计算，大概配置如下： CPU：intel Xeon X5650*2 内存：金士顿4G 1333*12 硬盘：ST SAS 450G 主板：intel S5520SC （网上看参数，只支持SATA II硬盘接口，是真的么？） 选用机架式，以便以后组集群，请高手给出修改建议！ 本人问题比较多，但金币不多，都是每天点击得来的，只能拿出100来，请不要嫌少。 ps：我也想多拿出一些金币，但是版内好多文章都要求金币>500才能看，所以没有办法啊。建议修改一下这种帖子，改成金币>500或者给本版贡献N（N<50)个金币也能看 [ Last edited by nkxiaowu on 2010-10-14 at 09:13 ] |
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abbott
金虫 (著名写手)
不要用QQ问我东西
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zhou2009(金币+3): 2010-10-14 09:19:41
nkxiaowu(金币+5):虽然不明白你是什么意思，但还是谢谢 2010-10-14 09:35:59
nkxiaowu(金币+10):多谢热心帮助！ 2010-10-15 20:53:25
zhou2009(金币+3): 2010-10-14 09:19:41
nkxiaowu(金币+5):虽然不明白你是什么意思，但还是谢谢 2010-10-14 09:35:59
nkxiaowu(金币+10):多谢热心帮助！ 2010-10-15 20:53:25
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G03E01-ia64-linux 楼主 去看看什么是计算机 什么是PC 你用的估计是PC 而且是x86的, 这里的x86就是平台架构, 你可以去查查, 计算机平台有很多的, 你下载的如果没有标注错, 那么ia是用于安腾处理器平台的, 不是atom处理器. (这个atom是个人计算机 x86架构的) ia标识, 是说, 根据源码, 针对ia架构的平台做的优化, 你拿到别的地方, 能运行, 那就运气了 用它作东西, 不知道有什么结果? 超线程? 过时了吧? 现在的CPU支持核心虚拟的(可以google一下) 不懂硬件, 就买成品. 话说, PC的内存, 和服务器的内存, 还是有区别的. intel新出的i7 i5 i3阿, 与服务器CPU没有任何关系.... |
2楼2010-10-13 22:42:30