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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 【讨论】关于md中系统稳定的问题
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xk6891

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 【讨论】关于md中系统稳定的问题 已有3人参与

小虫初涉md，问一个弱弱的问题
作完结构优化之后，看很多网上的资料都要求系统在热浴的环境中（是不是准确的应该说是在一定的系综下）跑一会儿，意思是说希望系统能在这个环境中稳定，如何判断系统在这个环境中是否达到了稳定？稳定之后，在做以下的性质计算时，是否还需要这个系综（譬如Nose Hoover热浴）的关键词？
急盼各位高手拍砖，谢谢
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人生自古多险阻，勤者自得天酬助。试问否泰何所依，枯藤老枝待新抽。临渊踌躇终迈步，振翅鹏起云霄冲。似是前程甚堪忧，他日振臂揽苍穹。
1楼 2010-10-12 15:51:15
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xk6891

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by manutdhk at 2010-10-14 09:31:00:


不敢当前辈，看到这词，如坐针毡啊。大家一起交流，以版友相称就好了。。

模拟退火，我不是很熟。但是退火的意思，就是将体系从高温，一下子降到某个低温。这是一种找极小值的最简单的方法而已。

各态历 ...

恩，确实需要好好看看书了。再次谢谢您的指导，很powerful。
希望继续交流。
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10楼2010-10-14 10:09:36
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xk6891

至尊木虫 (著名写手)
不好意思，自己顶一下
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人生自古多险阻，勤者自得天酬助。试问否泰何所依，枯藤老枝待新抽。临渊踌躇终迈步，振翅鹏起云霄冲。似是前程甚堪忧，他日振臂揽苍穹。
2楼2010-10-13 13:12:04
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manutdhk

木虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+4):谢谢 2010-10-13 17:02:14
xk6891(金币+5): 2010-10-13 18:18:06
引用回帖:
Originally posted by xk6891 at 2010-10-12 15:51:15:
小虫初涉md，问一个弱弱的问题
作完结构优化之后，看很多网上的资料都要求系统在热浴的环境中（是不是准确的应该说是在一定的系综下）跑一会儿，意思是说希望系统能在这个环境中稳定，如何判断系统在这个环境中是 ...

首先，不知道你要做什么性质的计算，平衡态还是非平衡态？
如果是平衡态的计算，所谓的稳定，确切地说应该是 热力学平衡。对于一个热力学系统，平衡是指 系统达到 吉布斯分布。NVT系综下，系统的温度与 热浴温度一致，能量在一定平衡值附近振荡……等等。

至于计算平衡态性质，是否需要继续保持该系综，理论上来说 其实问题不大。根据统计物理学原理，NVE系综和NVT系综，在热力学极限下，得到的结果是相一致的。
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3楼2010-10-13 15:36:56
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xk6891

至尊木虫 (著名写手)
★ ★ ★
zh1987hs(金币+3):鼓励交流 2010-10-13 18:59:19
引用回帖:
Originally posted by manutdhk at 2010-10-13 15:36:56:


首先，不知道你要做什么性质的计算，平衡态还是非平衡态？
如果是平衡态的计算，所谓的稳定，确切地说应该是 热力学平衡。对于一个热力学系统，平衡是指 系统达到 吉布斯分布。NVT系综下，系统的温度与 热浴 ...

先谢谢指导，呵呵，提的问题太不专业了。是平衡态，这一点应该说明。可以这样说么，譬如NVT系综，md结果当中ions的温度和electrons的动能应该在nose hoover设定的温度和动能值附近震荡，且粒子数目和所计算系统体积（晶胞大小）不变，这就可以说这个系统符合了NVT的系综，这个系统就稳定了。而如果是NPT系综就看输出文件中系统的压力和温度值的变化，如果其在设定值周围震荡，就可以说系统平衡了。
同时由于系统已经平衡了，可以认为系统已经满足了热力学极限的条件，此时在什么系综下已经不重要了，因为各个系综的情况已经相同。按照在某一系综下稳定的系统，再计算性质，加不加关键词以不重要。
不知这样理解是否正确？还请赐教
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人生自古多险阻，勤者自得天酬助。试问否泰何所依，枯藤老枝待新抽。临渊踌躇终迈步，振翅鹏起云霄冲。似是前程甚堪忧，他日振臂揽苍穹。
4楼2010-10-13 18:40:35
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