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virus501

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】实验啊,老做不出来(HEV(正链RNA病毒)的全基因组克隆) 已有2人参与

小弟一直在做HEV(正链RNA病毒,粪口传播)的全基因组克隆。可是一直没结果。现在把我的条件拿出来,请各位高手帮我分析一下原因吧,郁闷死了!
一:RNA的提取
    用OMEGA试剂盒提取猪粪中的RNA。(猪粪用PBS溶解)。
二:RT
    反转录用的是MBI试剂盒。RNA定量为1ug。反转录引物用过特异性引物和oligo(dT)。或者两者混合。
三:PCR
    PCR所用引物特异性很好(软件比对结果显示),cDNA加2ul。
四:目的片段
    一个长1.2k。一个约6.35k。1.2k的用的是TAKARA的普通Taq酶。6.35k的用的是TAKARA的LA Taq酶。
结果:
    可以说一直没有结果。1.2kP出的条带都小于500bp,要不就什么都没有。6.35k的结果也一样,要不什么都没有,要不在9.6k处有一条不清晰的带(不可能,因为HEV基因组全长才7.2k)。

说明:RNA肯定是提出来了,因为做阳性筛选的时候扩增的436bp的条带每次重复都会出现,即阳性对照没问题(扩增片段靠近基因组3’端);RT应该没问题,因为试剂盒中的阳性对照扩增也没问题。
  

    小弟真的很郁闷,一个简单的RT-PCR都做不好,也难怪2个老板都十分恼怒。请各位高手帮我分析分析原因吧,谢谢了!
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迷茫……
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zhandeguo1

银虫 (小有名气)

实验


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
革命尚未成功,同志任需努力啊!
2楼2010-09-30 19:37:43
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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
本帖仅楼主可见
3楼2010-09-30 19:39:23
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