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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】淀粉酶吸附
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leiyinwill

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】淀粉酶吸附 已有4人参与

看很多文献上面说淀粉酶对淀粉的降解一般都与淀粉酶和淀粉的吸附呈正相关。然而我最近做的却不是那么回事，现在就在查找这方面的文献。
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好好做实验！
1楼 2010-09-23 16:37:04
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lwiaanngg

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+3):鼓励交流，欢迎多多参与~ 2010-10-12 10:22:33
[quote]Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2010-10-04 19:45:43:


1、"回答：有文献报道结果G1和G2在同样反应体系下对可溶性淀粉的降解速率相似。“ 文献报道的一定真实么？

2、“回答：你的意思是G1和G2的结构上已经不能在同一个平面上比较，这个可以看它们的结构图，SBD与催化中心折叠后的结构图。而且，如果结构有所改变以至于影响steric factor和collision frequency，那么G1和G2在同样反应体系下对可溶性淀粉的降解速率应该迥异。”
G2+SBD后，你的effective collision和G2 必然是不同的。SBD 对 effective collision 应该有影响。如果没有，G2和G2+SBD 的反应速率应该相同，甚至于G2+SBD应该更慢，因为你增加了steric hindrance。但事实是增加了，所以其effective collision是不一样的。所以你更应该质疑那篇paper所讲G1和G2是否一样。不一定是作者有意，但有可能是作者实验设计不合理造成的。

3、“回答：我不做酵母，只是做淀粉酶，而这个淀粉酶是想要用来生产酒精，在生产酒精的工艺中需要酵母，我用的酵母为安琪酵母。虽然我们实验室也有好酵母，但还是用被外界所广为接受的酵母有说服力。至于在哪个国家热不热，我觉得还是去国外交流一下更好，可惜我没有被联合培养的福分。”
你不需要去国外看看，多看看paper就好。在biofuel，酵母正在被 algae 取代，看看大牛Jame Liao的文章就好。在Biodiesel，E.COLI更适应，看看另一位大牛Jay Kealsing的Nature了。酵母更多地是在于 volatile ester 的生产上，不过欧洲做的较多，例如Kevin Verstrepen。Yeast的代谢也是焦点，大牛huimin zhao在这方面很强的。

4、“回答：将淀粉和纤维素降解成为葡萄糖之后都可以生产乙醇的，美国已经用玉米淀粉来生产酒精很久了，只是遇到过一些阻力，有人反对用粮食来做酒精。作为一种可再生能源，姑且不论能量储备是否偏低，酒精还是可以作为备选燃料之一的，不论未来怎样，未雨绸缪总是好的。 ”
美国现在更多地在研究的是第三代的biofuel，不过工业目前ethanol还是主体。而且ethanol目前的产能/耗能比只有1.3：1，还是比较低的。所以butanol/isobutanol更加的热


5、“回答：不是相当难做，是相当相当的难做。不过这个材料也是很受关注的，来源极其广，储备量极其多，这两点比淀粉多多了。但这东西极其难降解，因为植物细胞壁的结构复杂，纤维素的结构也很复杂，具体可以看看丁士友的文章（似乎是中国人，后来留在美国，他儿子已经不会说中文了，跟他儿子说米粉要说noodle 的）他在美国做这个，提出了一个纤维素结构的新看法。对于纤维素酶来说，固相反应是限速步骤，预处理很麻烦的，我导师去年去过瑞典大学做过一个月的预处理。应用前景是好，但成本刚好相反，目前不是一般的高。我对纤维素酶的了解不多，只是以第二作者的身份发表了一篇IF2.6的文章。具体就是从水牛瘤胃内容物里拿到了5个比较新的纤维素酶基因，粗略的在E.coli BL21里表达了一下，宏基因组文库在那时候有点热。”
我也不直接做这个东西，只不过帮别人的忙了。也不算太太太难做了，毕竟现在很多已经被使用在biofuel/biodiesel生产当中了。例如Jay Kealsing。而且，很多的directed-evolution的重点都在这里，例如Francis Arnold, 我记得至少一篇PNAS谈论这个。BTW，10月1号的SCIENCE上有一篇关于用yeast降解cellulose的。
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14楼2010-10-05 09:04:08
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leiyinwill

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2010-09-23 19:11:49:
生淀粉酶？

就是淀粉酶啊，只是它可以降解生淀粉。
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好好做实验！
3楼2010-09-23 19:25:01
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
淀粉酶对淀粉的降解一般都与淀粉酶和淀粉的吸附呈正相关

只是说一般，没有说你的就是那样，正常
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流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
4楼2010-09-23 22:05:01
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lwiaanngg

铁杆木虫 (著名写手)
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silicare(金币+2):谢谢交流 2010-09-25 08:23:12
这个和吸附无关。应该说是碰撞，也就是酶反应中目前比较通用的collision theory。酶和底物之间的有效碰撞决定于反应效率
Kcoff和你的steric factor, collision frequency, media viscosity,particle size 相关。而且通过stokes-einstein equation, 你还可以得出和particle mobility相关

[ Last edited by lwiaanngg on 2010-9-25 at 00:12 ]
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5楼2010-09-25 00:10:52
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