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vasp001

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】重金悬赏 计算软件的几个问题,悬赏150个金币。

1。对于VASP 软件而言,计算使用的CPU 频率,内存,网络速度(选用的网络类型),硬盘转速,那些体系对于计算的速度影响较大。

2。对于Dmol3 而言,计算使用的CPU 频率,内存,网络速度(选用的网络类型),硬盘转速,那些体系对于计算的速度影响较大。
3。同样,对于Tran sistea ,而言呢?

4。
对于Gaussian呢?

5。对于ATK 呢?
6。对于ADF 呢


如果,大约想主要以VASP 计算为主,同时能够兼顾常用的计算软件?什么样的配置不错。初步预算在50万左右。

还请各位多加指导。关键,是VASP 和Dmol ,那些配置,如VASP Dmol3 等对CPU 主频和二级缓存,以及内存的依赖,什么样的配置可以显著提高计算速度?
请大家重点讨论这个。

[ Last edited by vasp001 on 2010-9-21 at 20:02 ]
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一定要精通MaterialsStudios,VASP.
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nkleof

银虫 (正式写手)

★ ★
mazuju028(金币+2):谢谢交流 2010-09-27 15:03:54
vasp001(金币+10): 2010-09-27 18:40:26
引用回帖:
Originally posted by vasp001 at 2010-09-20 18:38:16:
1。对于VASP 软件而言,计算使用的CPU 频率,内存,网络速度(选用的网络类型),硬盘转速,那些体系对于计算的速度影响较大。

2。对于Dmol3 而言,计算使用的CPU 频率,内存,网络速度(选用的网络类型),硬 ...

个人的使用经验,vasp对于内存和网络速度要求很高。计算一个稍微大点的体系,或者计算精度稍微提高,vasp要求的内存就会很大;而如果想要多个节点一起并行,网络速度非常重要,否则多个节点还不如一个节点快。我们实验室目前内存最大的节点有48G的,在计算表面体系和大分子的情况下仍然紧张;节点间采用千兆以太网不能满足并行要求,配置了Infiniband设备才真正发挥vasp的并行效率。
以上两个方面是发挥vasp速度的最重要环节,其它方面相对来说不敏感,当然单个节点内部cpu的频率越快是越好的。
9楼2010-09-27 09:34:56
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sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)


zzy870720z(金币+1):谢谢讨论 2010-09-20 19:22:36
引用回帖:
Originally posted by vasp001 at 2010-09-20 18:38:16:
1。对于VASP 软件而言,计算使用的CPU 频率,内存,网络速度(选用的网络类型),硬盘转速,那些体系对于计算的速度影响较大。

2。对于Dmol3 而言,计算使用的CPU 频率,内存,网络速度(选用的网络类型),硬 ...

虽然我也不清楚,感觉50万搞不定什么好的服务器吧。并行计算这几个条件都要高。为什么一定要自己建服务器呢,去超算中心吧
心之所向无惧无悔
2楼2010-09-20 18:53:56
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y1ding

铁杆木虫 (著名写手)


163.com(金币+1):谢谢回帖交流 2010-09-20 21:17:13
引用回帖:
Originally posted by ifmc1234 at 2010-09-20 19:04:59:



50万的预算,cluster大概也就是买8个节点吧,配置当然不是高端的。我倒觉得基本上够了。楼上说去超算中心,很多排队啊,很难有自己的足够的资源。建议自己买。
我想目前的一些主流配置(cluster)应该足够满 ...

如果允许自己组装的话,我们组在09年配了一个10个节点的cluster,才花了4万多。不过机柜是用原来的,没有新买。
感觉在北京自己搭一个,也就5~6万。
如果你们要走政府采购的话,就麻烦了。
4楼2010-09-20 21:11:31
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ifmc1234

木虫 (著名写手)


zxzj05(金币+1):谢谢回帖交流 2010-09-21 11:43:26
引用回帖:
Originally posted by y1ding at 2010-09-20 21:11:31:

如果允许自己组装的话,我们组在09年配了一个10个节点的cluster,才花了4万多。不过机柜是用原来的,没有新买。
感觉在北京自己搭一个,也就5~6万。
如果你们要走政府采购的话,就麻烦了。

09年配了一个10个节点的cluster,才花了4万多
真假的啊,一个节点才4000?
那是啥配置啊。。。。
5楼2010-09-20 21:52:54
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