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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】重金悬赏 计算软件的几个问题，悬赏150个金币。
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vasp001

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】重金悬赏 计算软件的几个问题，悬赏150个金币。

1。对于VASP 软件而言，计算使用的CPU 频率，内存，网络速度（选用的网络类型），硬盘转速，那些体系对于计算的速度影响较大。

2。对于Dmol3 而言，计算使用的CPU 频率，内存，网络速度（选用的网络类型），硬盘转速，那些体系对于计算的速度影响较大。
3。同样，对于Tran sistea ，而言呢？

4。
对于Gaussian呢？

5。对于ATK 呢？
6。对于ADF 呢


如果，大约想主要以VASP 计算为主，同时能够兼顾常用的计算软件？什么样的配置不错。初步预算在50万左右。

还请各位多加指导。关键，是VASP 和Dmol ，那些配置，如VASP Dmol3 等对CPU 主频和二级缓存，以及内存的依赖，什么样的配置可以显著提高计算速度？
请大家重点讨论这个。

[ Last edited by vasp001 on 2010-9-21 at 20:02 ]
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一定要精通MaterialsStudios,VASP.
1楼 2010-09-20 18:38:16
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

zd777

木虫 (正式写手)
★
zxzj05(金币+1):谢谢回帖交流 2010-09-21 11:43:38
vasp001(金币+5): 2010-09-21 20:00:43
vasp001(金币+5): 2010-09-27 18:40:18
计算机性能符合木桶原理，所以哪个都不能差，哪个差，哪个就是瓶颈，别的再高都是白搭。
50万的预算不多，建议先考虑高性能的CPU 配合稳定的主板，
内存看需要，不够的时候，以后再逐步加上去
网络速度（选用的网络类型），硬盘（似乎对服务器不只是转速决定的，要看硬盘的类型），这些预算还是先不要考虑了
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7楼2010-09-21 11:30:51
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ym23

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
mazuju028(金币+1):谢谢交流 2010-09-27 15:03:06
mazuju028(金币+1):谢谢交流 2010-09-27 15:04:04
aylayl08(金币+1): 2010-09-29 20:19:40
CPU核数和主频，内存容量和主频很关键，交换机一般都是千兆/百兆的，50万买dell的刀片服务器还可以吧，
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博观约取、厚积薄发---壁立千仞、无欲则刚
8楼2010-09-21 17:21:34
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普通回帖

sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)
★
zzy870720z(金币+1):谢谢讨论 2010-09-20 19:22:36
引用回帖:
Originally posted by vasp001 at 2010-09-20 18:38:16:
1。对于VASP 软件而言，计算使用的CPU 频率，内存，网络速度（选用的网络类型），硬盘转速，那些体系对于计算的速度影响较大。

2。对于Dmol3 而言，计算使用的CPU 频率，内存，网络速度（选用的网络类型），硬 ...

虽然我也不清楚，感觉50万搞不定什么好的服务器吧。并行计算这几个条件都要高。为什么一定要自己建服务器呢，去超算中心吧
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心之所向无惧无悔
2楼2010-09-20 18:53:56
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ifmc1234

木虫 (著名写手)
★ ★
zzy870720z(金币+2):谢谢讨论交流 2010-09-20 19:22:57
vasp001(金币+5): 2010-09-21 19:59:12
内容已删除
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3楼2010-09-20 19:04:59
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y1ding

铁杆木虫 (著名写手)
★
163.com(金币+1):谢谢回帖交流 2010-09-20 21:17:13
引用回帖:
Originally posted by ifmc1234 at 2010-09-20 19:04:59:



50万的预算，cluster大概也就是买8个节点吧，配置当然不是高端的。我倒觉得基本上够了。楼上说去超算中心，很多排队啊，很难有自己的足够的资源。建议自己买。
我想目前的一些主流配置(cluster)应该足够满 ...

如果允许自己组装的话，我们组在09年配了一个10个节点的cluster，才花了4万多。不过机柜是用原来的，没有新买。
感觉在北京自己搭一个，也就5~6万。
如果你们要走政府采购的话，就麻烦了。
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4楼2010-09-20 21:11:31
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ifmc1234

木虫 (著名写手)
★
zxzj05(金币+1):谢谢回帖交流 2010-09-21 11:43:26
引用回帖:
Originally posted by y1ding at 2010-09-20 21:11:31:

如果允许自己组装的话，我们组在09年配了一个10个节点的cluster，才花了4万多。不过机柜是用原来的，没有新买。
感觉在北京自己搭一个，也就5~6万。
如果你们要走政府采购的话，就麻烦了。

09年配了一个10个节点的cluster，才花了4万多
真假的啊，一个节点才4000？
那是啥配置啊。。。。
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5楼2010-09-20 21:52:54
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04nylxb

木虫 (正式写手)
★
zxzj05(金币+1):谢谢回帖交流 2010-09-21 11:43:33
这么多钱……
感觉多买几台IBM的服务器，然后请个高手过来帮你弄并行即可。
我们这边还用一台一台的台机连起来呢
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集中精力发文章
6楼2010-09-21 08:27:37
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nkleof

银虫 (正式写手)
★ ★
mazuju028(金币+2):谢谢交流 2010-09-27 15:03:54
vasp001(金币+10): 2010-09-27 18:40:26
引用回帖:
Originally posted by vasp001 at 2010-09-20 18:38:16:
1。对于VASP 软件而言，计算使用的CPU 频率，内存，网络速度（选用的网络类型），硬盘转速，那些体系对于计算的速度影响较大。

2。对于Dmol3 而言，计算使用的CPU 频率，内存，网络速度（选用的网络类型），硬 ...

个人的使用经验，vasp对于内存和网络速度要求很高。计算一个稍微大点的体系，或者计算精度稍微提高，vasp要求的内存就会很大；而如果想要多个节点一起并行，网络速度非常重要，否则多个节点还不如一个节点快。我们实验室目前内存最大的节点有48G的，在计算表面体系和大分子的情况下仍然紧张；节点间采用千兆以太网不能满足并行要求，配置了Infiniband设备才真正发挥vasp的并行效率。
以上两个方面是发挥vasp速度的最重要环节，其它方面相对来说不敏感，当然单个节点内部cpu的频率越快是越好的。
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9楼2010-09-27 09:34:56
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franch

版主 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
楼主最后搞了啥配置？
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遇弱则弱
10楼2011-05-08 17:53:54
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