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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】请教MS modeling 里的Display Style
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lgxyz

铜虫 (正式写手)

[交流] 【求助】请教MS modeling 里的Display Style 已有4人参与

各位，在MS modeling 里的Display Style 的Default，Incell，Orignal到底有什么区别，提交计算时用哪一种？另外计算前后不同序号的原子的位置会发生互换，大家又遇到过这种情况吗？怎么解决呀？多谢！
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1楼 2010-09-14 10:20:25
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渔火江枫

金虫 (小有名气)
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aylayl08(金币+3):感谢回复 2010-09-15 15:55:23
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Originally posted by lgxyz at 2010-09-15 08:50:14:
多谢！我看了下产生的CONTCAR的对应的原子的坐标就已经比原来大了一个晶格周期，后来我就自己动手减去了一个晶格周期。
还有对于周期体系来说，是不是只要原子个数一样，坐标可以不一样，但最后的能量应该一样的？

大体能明白你要表达的意思。对于一个有周期性边界条件的slab模型，结构优化后，边界的上的一个原子驰豫到下一周期，同样它上一个周期中相应的原子会有同样的动作，净的结果是原子个数没变，而优化结构坐标的变化是肯定有的。体系的能量决定于体系的几何结构（坐标），坐标不同，原则上体系的能量会不同
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7楼2010-09-15 10:03:18
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渔火江枫

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ym23(金币+1):欢迎常来交流 2010-09-14 16:59:27
引用回帖:
Originally posted by lgxyz at 2010-09-14 10:20:25:
各位，在MS modeling 里的Display Style 的Default，Incell，Orignal到底有什么区别，提交计算时用哪一种？另外计算前后不同序号的原子的位置会发生互换，大家又遇到过这种情况吗？怎么解决呀？多谢！

都一样,display style很明显是为了不同人的视图习惯设计的,其实提交计算的结构文件完全一致,不用在这上面太纠结. 你说的原子序号错位的情况我没有遇到过,不了解.
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2楼2010-09-14 14:03:15
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lgxyz

铜虫 (正式写手)
多谢！把CONCAR转化成.cif文件后用MS打开，显示了属于不同晶格的对应的相同序号的原子。请问你用什么来看CONTAR？
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3楼2010-09-14 14:29:14
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渔火江枫

金虫 (小有名气)
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引用回帖:
Originally posted by lgxyz at 2010-09-14 14:29:14:
多谢！把CONCAR转化成.cif文件后用MS打开，显示了属于不同晶格的对应的相同序号的原子。请问你用什么来看CONTAR？

你的描述太拗口，还是不太明白你的问题，很抱歉。我们也是把CONTCAR转成cif格式。或者你把两个结构文件发给我，看看能不能帮上。email: liuxingw3@163.com
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4楼2010-09-14 17:45:04
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