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lil33931687

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】求助高手帮忙 已有2人参与

最近投了一篇Acta e,编辑返回这样的评论：
1. The scheme still suffers from irregular shaped rings. The methoxy groups have to be replaced by "R" that are correctly positioned.
2. The Sheldrick citations are still wrong. See Acta home page for help and do use PUBLCIF for checking!
3. The su's of cell parameters are worse than before.

If you will not be able to upload satisfying cif and scheme within 1 week the manuscript will be rejected。
危险啊！我现在是一身冷汗！

第一条，画图。他让我把甲氧基用R代替，是这个意思吗，可是这样不能反映晶体的实际结构，我还从来没遇见过。
第二条，就是sheldrick的引用，我查看了许多文章，基本都这样引用，我也是，
Sheldrick, G. M. (2008). Acta Cryst. A64, 112-122.(cif里的格式）
可编辑说不对，也不知错在哪里，到底该怎么引用？
第三条，就是单胞参数问题，请问该怎么解决？
Alert level C
The least squares goodness of fit parameter lies
            outside the range 0.80 <> 2.00
            Goodness of fit given =      0.759
PLAT230_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff for    C35    --  C36     ..       5.89 su   
PLAT230_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff for    C37    --  C38     ..       5.30 su   
PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Sm1    --  O7      ..       8.44 su   
PLAT241_ALERT_2_C Check High      Ueq as Compared to Neighbors for         O4     
PLAT411_ALERT_2_C Short Inter H...H Contact  H24A   ..  H24A    ..       2.10 Ang.
PLAT141_ALERT_4_C su on a - Axis Small or Missing (x 100000) .....          1 Ang.
PLAT142_ALERT_4_C su on b - Axis Small or Missing (x 100000) .....          1 Ang.
PLAT143_ALERT_4_C su on c - Axis Small or Missing (x 100000) .....          1 Ang.
PLAT774_ALERT_1_C Suspect X-Y Bond in CIF:   SM1    --  SM1     ..       3.95 Ang.

Alert level G
PLAT343_ALERT_2_G Check         Angle Range in Main Residue for ..        C29      
PLAT154_ALERT_1_G The su's on the Cell Angles are Equal  (x 10000)        100 Deg.
PLAT164_ALERT_4_G Nr. of Refined C-H H-Atoms in Heavy-Atom Struct.          1      
PLAT180_ALERT_4_G Check Cell Rounding: # of Values Ending with 0 =          3

请高手不吝赐教！，谢谢！
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1楼 2010-09-14 08:27:12
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
帝夫(金币+3):感谢回帖交流！ 2010-09-14 09:10:50
1。 听他的
2。
http://journals.iucr.org/c/services/authorservices.html

Sheldrick, G. M. (2008). Acta Cryst. A64, 112-122.

3。 查原始记录
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xi2004-emuch@163.com
2楼2010-09-14 08:40:10
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lil33931687

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2010-09-14 08:40:10:
1。 听他的
2。
http://journals.iucr.org/c/services/authorservices.html

Sheldrick, G. M. (2008). Acta Cryst. A64, 112-122.

3。 查原始记录

谢谢！我比较菜，请老师说详细点。
第二条，我已经pubcif了，没什么问题啊，可编辑说有问题，
Sheldrick, G. M. (2008). Acta Cryst. A64, 112-122. 以前这样都通过了，真的不知道问题出哪里。
第三条，请问su值是什么意思，是不是单胞长宽高后面括号里的数字，我已经改过了啊，且和checkcif后原始数字一致, 请老师帮忙解决这个c级错误。
The least squares goodness of fit parameter lies
            outside the range 0.80 <> 2.00
            Goodness of fit given =      0.759
PLAT230_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff for    C35    --  C36     ..   5.89 su   
PLAT230_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff for    C37    --  C38     ..   5.30 su   
PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Sm1    --  O7      .. 8.44 su   
PLAT241_ALERT_2_C Check High      Ueq as Compared to Neighbors for         O4     
PLAT411_ALERT_2_C Short Inter H...H Contact  H24A   ..  H24A    ..       2.10 Ang.
PLAT141_ALERT_4_C su on a - Axis Small or Missing (x 100000) .....          1 Ang.
PLAT142_ALERT_4_C su on b - Axis Small or Missing (x 100000) .....          1 Ang.
PLAT143_ALERT_4_C su on c - Axis Small or Missing (x 100000) .....          1 Ang.
PLAT774_ALERT_1_C Suspect X-Y Bond in CIF:   SM1    --  SM1     ..       3.95 Ang.

Alert level G
PLAT343_ALERT_2_G Check         Angle Range in Main Residue for ..        C29      
PLAT154_ALERT_1_G The su's on the Cell Angles are Equal  (x 10000)        100 Deg.
PLAT164_ALERT_4_G Nr. of Refined C-H H-Atoms in Heavy-Atom Struct.          1      
PLAT180_ALERT_4_G Check Cell Rounding: # of Values Ending with 0 =     3
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3楼2010-09-14 11:47:08
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
nash603(金币+1):谢谢回贴交流！ 2010-09-15 08:05:25
lil33931687(金币+10): 2010-09-15 08:26:07
第三条，原始是怎样就怎样， 为何要改呢？ 你要回头去查一下原始的。
第二条，请问在啥地方引用到的， 你是怎么引用的， 贴上来看看。
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xi2004-emuch@163.com
4楼2010-09-14 22:50:17
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lil33931687

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2010-09-14 22:50:17:
第三条，原始是怎样就怎样， 为何要改呢？ 你要回头去查一下原始的。
第二条，请问在啥地方引用到的， 你是怎么引用的， 贴上来看看。

谢谢！
我是这样引用的:
Sheldrick, G. M. (2008). Acta Cryst. A64, 112-122.
这是在cif里的格式，不知错在哪里？
su的原始数据是这样的：
_cell_length_a                    12.36960(10)
_cell_length_b                    12.43440(10)
_cell_length_c                    14.74670(10)
_cell_angle_alpha                 90.6410(10)
_cell_angle_beta                  103.4920(10)
_cell_angle_gamma                 116.6480(10)

check的结果是：
The least squares goodness of fit parameter lies
            outside the range 0.80 <> 2.00
            Goodness of fit given =      0.766
PLAT230_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff for    C35    --  C36     ..   5.89 su   
PLAT230_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff for    C37    --  C38     ..   5.30 su   
PLAT232_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff (M-X)  Sm1    --  O7      .. 8.44 su   
PLAT241_ALERT_2_C Check High      Ueq as Compared to Neighbors for         O4     
PLAT411_ALERT_2_C Short Inter H...H Contact  H24A   ..  H24A    ..       2.10 Ang.
PLAT141_ALERT_4_C su on a - Axis Small or Missing (x 100000) .....         10 Ang.
PLAT142_ALERT_4_C su on b - Axis Small or Missing (x 100000) .....         10 Ang.
PLAT143_ALERT_4_C su on c - Axis Small or Missing (x 100000) .....         10 Ang.
PLAT774_ALERT_1_C Suspect X-Y Bond in CIF:   SM1    --  SM1     ..       3.95 Ang.
我以前只是把abc后面括号里的10改成1，实际check结果前后是一样的。
请老师帮我解决一下这两个问题，非常感谢！！
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5楼2010-09-15 08:58:44
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lil33931687

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2010-09-14 22:50:17:
第三条，原始是怎样就怎样， 为何要改呢？ 你要回头去查一下原始的。
第二条，请问在啥地方引用到的， 你是怎么引用的， 贴上来看看。

我是在 _publ_section_references 下面引用的：
Sheldrick, G. M. (2008). Acta Cryst. A64, 112-122。

另外cif自动生成有这：
_exptl_absorpt_process_details    'SADABS (Sheldrick, 1996)'

是否必须引用1996年的？
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6楼2010-09-15 09:12:18
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
偏差都是10的罕见。
所以才要查查原始还原得到的单胞是怎样的。

那个引用要看看你正文中在哪里引用到。
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xi2004-emuch@163.com
7楼2010-09-15 09:26:08
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lil33931687

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2010-09-15 09:26:08:
偏差都是10的罕见。
所以才要查查原始还原得到的单胞是怎样的。

那个引用要看看你正文中在哪里引用到。

谢谢老师，那么这个su's是不是就不用去管它了?

shielrrick我正文没地方引用到，其他人也都是这样的，它应该是自动生成的，我可能缺了1996年的。
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8楼2010-09-15 10:02:34
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by lil33931687 at 2010-09-15 10:02:34:

谢谢老师，那么这个su's是不是就不用去管它了?


要和编辑解释一下。
但我也不太相信那么凑巧都是10.

shielrrick我正文没地方引用到，其他人也都是这样的，它应该是自动生成的，我可能缺了1996年的。

对了， 看看最近的文章，人家怎么引用， 照样做就是了。
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xi2004-emuch@163.com
9楼2010-09-15 15:26:34
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