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bbslover金虫 (正式写手)
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【求助】sybyl画分子的一个问题，什么叫 carboxyl O-protonated ？ 已有2人参与
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下面是文献中的一句话： DOCK6.0 (51,52) b was employed to dock all the inhibitors into the P-selectin binding pocket, which the carboxyl O-protonated forms of the molecules were used in the calculations. 什么叫carboxyl O-protonated ，使用sybyl画完分子怎么操作呢，才能质子化，有的文献还经常说把 N 原子 质子和，这样做的依据是什么呢？ 还有质子化是不是就是更改一下 原子的类型就好了？ 估计质子化与否应该影响静电效应，可是我们怎么知道什么时候要进行质子化处理呢？ 谢谢！ |
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