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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】帮忙VASP写个小程序
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wo8165827

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】帮忙VASP写个小程序 已有4人参与

用Linux帮忙VASP写个小程序，

要求：
1 查找到某一目录下文件夹中的OZSICAR
2 提取OZSICAR中最后一个E0的数据，如提取“ E0= -.73812181E+01”  （OZSICAR中有很多E0）
3 将提取的E0数据放到一个文件下"log"
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1楼 2010-09-11 15:50:16
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ifmc1234

木虫 (著名写手)
★ ★
wo8165827(金币+1):谢谢参与
zzy870720z(金币+1):谢谢回复 2010-09-12 09:17:44
wo8165827(金币+1):3 2010-09-12 14:33:14
wo8165827(金币+2): 2010-09-12 14:33:26
引用回帖:
Originally posted by sunyang1988 at 2010-09-11 21:01:42:

在主目录下
grep "E0= " */OZSICAR | tail -1 | awk '{print $5}' >>log
试试吧

楼上正解，直接用bash里的脚本就行，没必要编程。
赞一下(2人) 回复此楼
9楼2010-09-11 21:03:47
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ifmc1234

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+2):谢谢详细指点 2010-09-13 08:26:52
wo8165827(金币+3):xiexie 2010-09-13 09:06:45
引用回帖:
Originally posted by wo8165827 at 2010-09-12 16:02:19:


好像不行的。我建了一个run.sh文件。然后把你的命令加上。运行完后log里就只有一个‘E0=’ 其他数据都没有。

[ Last edited by wo8165827 on 2010-9-12 at 16:03 ]

run.sh 文件里
第一行：#!/bin/bash 或者 #!/bin/sh
第二行 空
第三行开始是上面的命令。

其实就一行的命令，没必要写入脚本文件中。
我说的脚本指的是在linux脚本环境。

我猜你的不执行，可能是没加第一行。。。。。。
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13楼2010-09-12 19:18:16
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ifmc1234

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by wangle_xq at 2010-09-13 13:35:20:


发完了才想起来，关于OSZICAR中的能量值。如果有多个，是由于几何优化产生的结果。VASP的手册上曾经有这么一段记述。在使用能量值的时候，不要使用几何优化产生的能量，要在几何优化结束以后另外固定原子位置 ...

这哥们很牛啊
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21楼2010-09-13 18:08:00
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