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fly_elephan

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[交流] vasp计算结果处理态密度要用到的程序已有7人参与

在材料电学特性的研究中，能带和态密度是我们最关心的，下面的这个程序可以用于vasp计算结果的处理，可以分离出总态密度和分态密度，这个程序是我们研究所用了很久的，绝对没问题，有资源大家共享，欢迎下载。
#! /bin/ksh
# Script to break the VASP DOSCAR file into segments for
# each atomic site.
# JMS NRL 5/0/02

# Modified to also align the Fermi level from the ground state
# to E=0.0
# JMS NRL 6/19/02

# Executables reside here
BIN=~/tzyy/AlP/swnt10

if [ $# -ne 0 ]; then
echo "Usage: split_dos"
exit 2
fi

# Script to split the DOSCAR file into the atomic
# projections labeled by atom number
dosfile=DOSCAR
outfile=OUTCAR
infile=INCAR

# Token for splitting the files
token=$(sed -n '6 p' $dosfile | awk '{print $1}')

# Number of points
nl=$(sed -n '6 p' $dosfile | awk '{print $3}')

# Number of atoms
natom=$(sed -n '1 p' $dosfile | awk '{print $1}')

# Get the Fermi level if the OUTCAR file is present,
# else we set it to zero.
if [ -a $outfile ]; then
echo "The" $outfile "exists, we use it to get the Fermi level,"
echo "the RWIGS tag and the number of spins."
efermi=$(grep "E-fermi" $outfile | tail -1 | awk '{print $3}')
echo "Fermi level:" $efermi
nspin=$(grep "ISPIN" $outfile | tail -1 | awk '{print $3}')
if [ $nspin -eq 2 ]; then
echo "Spin polarized calculation"
else
echo "Unpolarized calculation"
fi

# 2.a
# JMS 2/3/03 Modified to accept specification by LORBIT token.
#
lorbit=$(grep "LORBIT" $outfile | tail -1 | awk '{print $3}')
if [ $lorbit -ge 10 ]; then
      echo "LORBIT > 10"
      echo "WARNING: not completely test for vasp.4.*"
echo "Use at your own risk. Please check results for consistency."
form=1
else
# 2.a
rwigs=$(grep "RWIGS" $outfile | tail -1 | awk '{print $3}' | sed 's/\.//g')
if [ $rwigs -eq -100 ]; then
      echo "RWIGS token not set"
      form=0
else
      echo "RWIGS token set"
      form=1
fi
# 2.a
fi
# 2.a

else
echo "The" $outfile "does not exist, we set the Fermi level to 0"
echo "assume an unpolarized calculation, and RWIGS not set"
form=0
nspin=1
efermi=0.0
fi

# If the outcar file is not present and you wish to set something by hand
# you should do it here. Uncomment the tokens below and set them by hand.

#efermi=2.255
#form=
#nspin=

# Get the atomic coordinates
$BIN/vp >| tmp.dat
tail -$natom tmp.dat | awk '{printf "%s %12.8f %12.8f %12.8f \n", "#", $2, $3, $4}' >| tmp.dat2

# Total is first DOS
if [ $form -eq 0 ]; then
i=0
else
i=0
fi

start=7
end=$((start+nl-1))
#echo $start $end
#exit 0
rm -f DOS0
if [ $form -eq 1 ]; then

while [ $i -le $natom ]; do

#echo $i $start $end

if [ $i -gt 0 ]; then
      sed -n ''$i' p' tmp.dat2 >| DOS$i
fi

if [ $i -gt 0 ]; then

# Atomic projected DOS
      if [ $nspin -eq 2 ]; then
sed -n ''$start','$end' p' $dosfile | awk '{printf "%12.8f %12.8f %12.8f %12.8f %12.8f %12.8f %12.8f \n", $1+(-1)*'$efermi', $2, -1*$3, $4, -1*$5, $6, -1*$7}' >> DOS$i
      else
sed -n ''$start','$end' p' $dosfile | awk '{printf "%12.8f %12.8f %12.8f %12.8f \n", $1+(-1)*'$efermi', $2, $3, $4 }' >> DOS$i
      fi

else

# Total DOS
      if [ $nspin -eq 2 ]; then
sed -n ''$start','$end' p' $dosfile | awk '{printf "%12.8f %12.8f %12.8f %12.8f %12.8f \n", $1+(-1)*'$efermi', $2, -1*$3, $4, -1*$5 }' >> DOS$i
      else
sed -n ''$start','$end' p' $dosfile | awk '{printf "%12.8f %12.8f %12.8f \n", $1+(-1)*'$efermi', $2, $3 }' >> DOS$i
      fi

      fi

start=$((end+2))
end=$((start+nl-1))
i=$((i+1))
done

else

while [ $i -le 0 ]; do

#echo $i $start $end

if [ $i -gt 0 ]; then
      sed -n ''$i' p' tmp.dat2 >| DOS$i
fi

if [ $i -gt 0 ]; then

# Atomic projected DOS
      if [ $nspin -eq 2 ]; then
sed -n ''$start','$end' p' $dosfile | awk '{printf "%12.8f %12.8f %12.8f %12.8f %12.8f %12.8f %12.8f \n", $1+(-1)*'$efermi', $2, -1*$3, $4, -1*$5, $6, -1*$7}' >> DOS$i
      else
sed -n ''$start','$end' p' $dosfile | awk '{printf "%12.8f %12.8f %12.8f %12.8f \n", $1+(-1)*'$efermi', $2, $3, $4 }' >> DOS$i
      fi

else

# Total DOS
      if [ $nspin -eq 2 ]; then
sed -n ''$start','$end' p' $dosfile | awk '{printf "%12.8f %12.8f %12.8f %12.8f %12.8f \n", $1+(-1)*'$efermi', $2, -1*$3, $4, -1*$5 }' >> DOS$i
      else
sed -n ''$start','$end' p' $dosfile | awk '{printf "%12.8f %12.8f %12.8f \n", $1+(-1)*'$efermi', $2, $3 }' >> DOS$i
      fi

      fi

start=$((end+2))
end=$((start+nl-1))
i=$((i+1))
done

fi

exit 0

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1楼2011-05-30 10:09:48

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zzy870720z(金币+2): 谢谢指教 2011-05-30 15:23:30

这个程序vtstool code中有的。

你们组看起来是做单壁纳米管的，所以这个脚本可以一直用着。

如果含有f电子，就没有办法用了。LORBIT = 11和LORBIT = 10是有很大差异的，这个脚本需要修改才能用。

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哥是传说

2楼2011-05-30 11:01:16

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wujing110

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3楼2011-11-14 11:21:03

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3楼: Originally posted by wujing110 at 2011-11-14 11:21:03:
请问区长童鞋，LORBIT = 11时候应该怎么改呀？我设置LORBIT = 11，一共有19列数据，但是我现在只想要 s+,s-,p+,p-,d+,d-，那些角动量分量要一列一列加成总的么？

是啊。第四列到九列是p的三个分量及上下旋。三个奇数列相加的p+，三个偶数列相加的p-。后面10列是d分量及自旋。上旋和下旋分别相加。

可以用excel或者origin来做列的相加。

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4楼2011-11-14 13:21:54

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gougou531

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5楼2011-11-14 14:05:43

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5楼: Originally posted by gougou531 at 2011-11-14 14:05:43:
区长，我i怎么觉得这些数据是在procar中，不是在doscar中，设置lorbit=11只是影响doscar，doscar影响小吧，只是当lorbit=11时doscar中像O原子会有d轨道的分量。谢谢

POSCAR和PROCAR中都有。至于二者有什么区别，我没有研究过~

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6楼2011-11-14 14:06:49

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7楼2011-11-14 14:09:06

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7楼: Originally posted by gougou531 at 2011-11-14 14:09:06:
我的DOSCAR中，只有s，p，d的上下自旋，没有你说的将P轨道投影到px，py，pz啊。这是怎么回事，是我的设置有问题

要保证所用的势是pw91。

千万千万要仔细看手册。这是千百年来，学习vasp和其他软件的人的忠告~

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8楼2011-11-14 14:11:09

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wujing110

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9楼2011-11-14 16:40:10

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9楼: Originally posted by wujing110 at 2011-11-14 16:40:10:
谢谢区长童鞋
我还要一个问题就是，我看到文献中有做出t2g和eg轨道的图，t2g由dxy,dxz,dyz组成么？那我把对应的这几列相加就是t2g轨道么？那 eg轨道呢？求区长给讲解讲解

这个是d五重兼并轨道（能级）的分裂。分裂成上两组，两上三下或者三上两下。三个一组的是t2g，两个一组的是eg。这两组兼并能级为什么要加和呢？

加不加随你吧，我也不清楚你要干什么用。要注意的是t2g和eg所对应的是什么。dxy之类的d后面的下标与你的晶胞坐标轴的选取有关。

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10楼2011-11-14 16:50:58

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