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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Semi-empirical » 【求助】重金求专家解决：如何给过渡金属加半经验参数？
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x7511413

金虫 (正式写手)

科研小菜

[交流] 【求助】重金求专家解决：如何给过渡金属加半经验参数？

各位专家：你们好！
   我用半经验方法优化不了 Cu, Pt等重金属或过渡金属。可是发表在JACS上的一篇文献做到了。他们是怎么做到的呢？
  文献题目为：Carbonyl-Ene Reactions Catalyzed by Bis(oxazoline) Copper (II) Complexes Proceed by a Facile Stepwise Mechanism: DFT and ONIOM (DFT:  PM3)
Studies

他是这样做到的：The ONIOM calculations were carried out with a slightly modified version of Gaussian98 developed by us which incorporates the semiempirical parameterization for transition metals (from ref. 11).  其中 ref.11 :为 (a) Thiel, W.; Voityuk, A. A. Theor. Chim. Acta 1992, 81, 391 404. (b)
Thiel, W.; Voityuk, A. A. Theor. Chim. Acta 1996, 93, 315. (c)
HyperChem, Hypercube, Inc.: Gainesville, FL  三篇参考文献。
            我想知道怎样给过渡金属加半经验参数呢？具体怎么操作呢？

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-9-7 at 12:32 ]
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哦也
1楼 2010-09-06 19:54:08
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recoli

金虫 (正式写手)
★
heyo_123(金币+1):鼓励讨论！！ 2010-09-07 08:56:33
x7511413(金币+2): 2010-09-08 08:42:21
加参数要搞源代码，麻烦。LZ要是有高斯09就可以用PM6方法，或者免费的MOPAC2009（现在大概有新版本了）也有PM6方法，涵盖了周期表的大多数元素。

但是金属本身就是量化的难点，用半经验方法的可靠与否需要再三检查。
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2楼2010-09-06 20:40:15
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x7511413

金虫 (正式写手)

科研小菜
引用回帖:
Originally posted by recoli at 2010-09-06 20:40:15:
加参数要搞源代码，麻烦。LZ要是有高斯09就可以用PM6方法，或者免费的MOPAC2009（现在大概有新版本了）也有PM6方法，涵盖了周期表的大多数元素。

但是金属本身就是量化的难点，用半经验方法的可靠与否需要再三 ...

谢谢您的回复。请问上面这篇文献也是改代码解决的吗？因为我的体系实在太大了 用半经验才速度快一些哦 。
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哦也
3楼2010-09-06 21:49:27
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x7511413

金虫 (正式写手)

科研小菜
引用回帖:
Originally posted by recoli at 2010-09-06 20:40:15:
加参数要搞源代码，麻烦。LZ要是有高斯09就可以用PM6方法，或者免费的MOPAC2009（现在大概有新版本了）也有PM6方法，涵盖了周期表的大多数元素。

但是金属本身就是量化的难点，用半经验方法的可靠与否需要再三 ...

请问您说的PM6计算的时间和PM3差别大吗？
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哦也
4楼2010-09-06 21:50:59
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recoli

金虫 (正式写手)
"a slightly modified version of Gaussian98 developed by us"，应该是作者自己修改了代码的。

PM6也很快的，毕竟是半经验，用现在的电脑都是随便算算就出结果了。
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5楼2010-09-07 09:42:20
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x7511413

金虫 (正式写手)

科研小菜
引用回帖:
Originally posted by recoli at 2010-09-07 09:42:20:
"a slightly modified version of Gaussian98 developed by us"，应该是作者自己修改了代码的。

PM6也很快的，毕竟是半经验，用现在的电脑都是随便算算就出结果了。

谢谢您的回复，请问我下载的MOPAC2009中怎么只有PM5 没有PM6 呢？
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哦也
6楼2010-09-07 14:55:00
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recoli

金虫 (正式写手)
x7511413(金币+1): 2010-09-08 08:42:55
引用回帖:
Originally posted by x7511413 at 2010-09-07 14:55:00:

谢谢您的回复，请问我下载的MOPAC2009中怎么只有PM5 没有PM6 呢？

我是从openmopac.net下载的。
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7楼2010-09-07 15:51:17
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x7511413

金虫 (正式写手)

科研小菜
引用回帖:
Originally posted by recoli at 2010-09-07 15:51:17:

我是从openmopac.net下载的。

那请问您的里面有PM6吗？ 您的这个软件是在什么平台上运行的呢？是通过Chem3D吗？谢谢
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哦也
8楼2010-09-07 17:06:04
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x7511413

金虫 (正式写手)

科研小菜
引用回帖:
Originally posted by recoli at 2010-09-07 15:51:17:

我是从openmopac.net下载的。

您好！ 请问用163的邮箱可以下载吗？
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哦也
9楼2010-09-08 08:43:39
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manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人
你的体系有多大啊？我120个原子 40多个重原子 全基组b3lyp/6-31g还可以
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惺惺相惜情不自禁
10楼2010-09-08 09:13:23
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