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peakyu

银虫 (正式写手)


[交流] 【求助】求助两个A类错误

如题:
SYMMG02_ALERT_1_A        The _symmetry_equiv_pos_as_xyz values are inconsistent
                     with the H-M symbol given
           From the CIF: _symmetry_equiv_pos_as_xyz
                                             x, y, z
                                             -x, y+1/2, -z+1/2
                                             -x, -y, -z
                                             x, -y-1/2, z-1/2
           These symops generate the Hall space group symbol   -p_2ybc
           From the CIF: _symmetry_space_group_name_H-M     p21
           From the xyz: _symmetry_space_group_name_H-M     p_1_21/c_1
                     ALERT     4 symops in cif,     2 symops generated
PLAT242_ALERT_2_A Check Low       Ueq as Compared to Neighbors for        N15
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Inorg@USF

木虫 (正式写手)

★ ★
peakyu(金币+2):谢谢参与
帝夫(金币+1):感谢回帖交流! 2010-09-06 08:07:58
错误可能是出现在你对空间群的指定错误,你可以检验一下空间群和相应的对称操作是否完全匹配,包括是否和所有的坐标配置相匹配。这个很容易解决,你可以利用一个小工具,名字叫Space group exlorer (可以查看我发的帖子)。你的A alert报告很明确的说你的cif给的名字是P21,但是根据XYZ对称操作,空间群应该是P21/C,所以你要考虑是不是你是不是把对称性定低了,还是你的晶体是twins,可以通过解析孪晶的命令验证一下即可。

还有就是你的空间群符号不能包括下标格式和括号,必须在不同的坐标方向的对称元素间空格!譬如

正确的
'P 21 21 21'

不正确的

'P2~1~2~1~2~1~' or 'P212121'
引用回帖:
Originally posted by peakyu at 2010-09-05 17:57:58:
如题:
SYMMG02_ALERT_1_A        The _symmetry_equiv_pos_as_xyz values are inconsistent
                     with the H-M symbol given
           From the CIF: _symmetry_equiv_pos_as_xyz
        ...

[ Last edited by Inorg@USF on 2010-9-6 at 04:05 ]
There is a will,there is a way.
3楼2010-09-06 04:00:02
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cfocus20

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
peakyu(金币+2):谢谢参与
帝夫(金币+1):感谢回帖交流! 2010-09-06 08:07:52
對稱性有錯誤, space group 應該是判斷錯誤!
Smart_work_and_beautiful_life!
2楼2010-09-05 21:07:53
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linhua0402313

版主 (文坛精英)

★ ★
peakyu(金币+2):谢谢参与
帝夫(金币+1):感谢回帖交流! 2010-09-06 08:08:03
第一个可能是空间群错误,你可以使用platon检查下空间群
第二个试一下命令isor 0.001 N15
身在高山独抚琴,心随流水会知音
4楼2010-09-06 07:46:48
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