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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 【请教】请教晶体解析中遇到的一个基本概念 已有2人参与

最近刚开始学习晶体解析,在许多软件中看到“MAPS”的菜单,想请教一下,这里的MAPS主要包含哪些重要的概念,可对晶体的解析有所帮助。比如MAPS中的MASK是用来表达什么内容的?“VIODS”又指得是什么?“ELECTRON DENSITY”能说明什么问题?
多谢指教!
谢谢!!
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

引用回帖:
Originally posted by cluster8676 at 2010-08-28 10:55:59:
我也刚刚接触晶体解析,一般只用shelxtl,我看到过PLATON里面有MAPS这个命令,我觉得就是用来生成图形的。 Electron density 就是根据你一个unit cell 里面所有的电子除以你的unit cell的体积。 如果你解出的结构 ...

电子密度图能看出什么?如下图所示的电子密度等高线图:
3楼2010-08-28 15:59:51
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
eeqeeq0002:谢谢 参与 2010-08-28 12:37:50
yytsnake(金币+5):多谢指教!电子密度图有什么用处? 2010-08-28 15:54:40
我也刚刚接触晶体解析,一般只用shelxtl,我看到过PLATON里面有MAPS这个命令,我觉得就是用来生成图形的。 Electron density 就是根据你一个unit cell 里面所有的电子除以你的unit cell的体积。 如果你解出的结构所对应的electron density 小于数据收集而得到的electron density的话,就可以说你有
VIODS,指的是你的unit cell 里面的空隙,比如说你有溶剂分子没有找出来。如果大于应该就叫MASK就是说你有些原子或者分子是不应该出现的。

这是我的理解,没有看过什么资料,还请多多指教
学无止境
2楼2010-08-28 10:55:59
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
wsht212:谢谢交流,希望常来! 2010-08-29 13:21:09
我也不明白,呵呵,应该是根据电子密度图确定原子的位置吧,密度高的地方就是重原子,低的就是轻原子,这个我真的不懂。。。不能误导你,呵呵
学无止境
4楼2010-08-29 02:45:19
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