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日不落金虫 (著名写手)
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【请教】解析结构指令说明已有5人参与
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初学者请教问题：望解答的虫友们，最好能具体说明一下，谢谢赐教，重金酬谢！ 1、在解析晶体结构的时候，ins或者res文件里的omit 与exti指令是什么意思，用它们的意义何在？望高手解说，谢谢！ 2、当在精修的时候，权重计算复制黏贴时，R1、wR2值减小，而GooF=S值增大；这是什么原因呢？ 当我将lst文件的most disagreeable reflections中 Delta(F^2)/esd 值大于5的用omit命令之后，精修，R1、wR2、GooF=S都降低，但是系统给出的权重值反而增加，将其复制黏贴精修后，又出现R1、wR2值减小，GooF=S值增大，这是怎么回事呢？ |
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huahua1216
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2楼2010-07-08 10:16:23
日不落
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3楼2010-07-08 10:37:08
huahua1216
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4楼2010-07-08 10:59:22
hao_jian
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5楼2010-07-08 11:16:59
linhua0402313
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yunruirui(金币+2):很详尽，谢谢交流，希望常来 2010-07-08 14:44:42
日不落(金币+20):谢谢热心解答！ 2010-07-08 18:24:11
yunruirui(金币+2):很详尽，谢谢交流，希望常来 2010-07-08 14:44:42
日不落(金币+20):谢谢热心解答！ 2010-07-08 18:24:11
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1、在解析晶体结构的时候，ins或者res文件里的omit 与exti指令是什么意思，用它们的意义何在？ 解答：omit指令是使用于删除某些衍射点使之不参与结构修正以及Fourier计算，它的格式有两种，一种删除某些设定的角度之间的衍射点，另一种是删除某些特殊的衍射点； exti是使用于校正因二次消光引起的衍射点强弱的衰减，在xl修正中，若消光比较严重而ins文件中没有设置exti时，系统将给出提示 2、当在精修的时候，权重计算复制黏贴时，R1、wR2值减小，而GooF=S值增大；这是什么原因呢？ 解答：权重的调节是等到你的晶体解析差不多的时候，也就是空间群用platon检查没有问题了，R1、wR2值也基本符合条件再去调节的，一般只要复制res文件中的权重值到ins文件中再xl就可以了，除非结构还没有解析完好，或者晶体数据本身就不好，否则GOF值一般接近于1，最好不要再解析过程就去调节权重值，这样根本就不是很准确。 |
6楼2010-07-08 11:56:42
7楼2010-07-08 14:45:49
日不落
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8楼2010-07-08 18:26:59
linhua0402313
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9楼2010-07-08 18:55:51
日不落
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由于心急毕业，对晶体方面又不懂，同课题组中其他成员和老师都是有机方面的，对这方面一点都不沾边，所以就匆匆投了一篇文章，几个小时后，编辑者给我修改的意见，其中最重要的是：a systematic error for the reflections in the resolution shell 0.93-0.89 A (see SHELXL output file - most disagreable reflections). This is a source of large peaks and holes in the final difference Fourier map. The data have to be reprocessed and the scaling procedure carrefully checked.于是我就将一些衍射点用omit指令，GooF从1.276降到1.1几了，但是权重也改变了，再权重计算时，GooF又升为1.27了，（我是从Delta(F^2)/esd大于5以上的用omit），而且Delta(F^2)/esd 中又有很多大于5的。请问这该怎么办呀？谢谢赐教。 |
10楼2010-07-09 09:44:47