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日不落

金虫 (著名写手)

[交流] 【请教】解析结构指令说明已有5人参与

初学者请教问题:望解答的虫友们,最好能具体说明一下,谢谢赐教,重金酬谢!

1、在解析晶体结构的时候,ins或者res文件里的omit 与exti指令是什么意思,用它们的意义何在?望高手解说,谢谢!

2、当在精修的时候,权重计算复制黏贴时,R1、wR2值减小,而GooF=S值增大;这是什么原因呢?
当我将lst文件的most disagreeable reflections中  Delta(F^2)/esd  值大于5的用omit命令之后,精修,R1、wR2、GooF=S都降低,但是系统给出的权重值反而增加,将其复制黏贴精修后,又出现R1、wR2值减小,GooF=S值增大,这是怎么回事呢?
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日不落

金虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by linhua0402313 at 2010-07-08 18:55:51:



你只要移动一次复制黏贴res文件中的权重值到cif进行xl就可以了,如果再继续进修,权重就会不断的改变,一般GOF接近1最好,也不一定都要接近于1,有些文献上就没有接近1。基本不大于1.3都可以,主要看晶体数 ...

由于心急毕业,对晶体方面又不懂,同课题组中其他成员和老师都是有机方面的,对这方面一点都不沾边,所以就匆匆投了一篇文章,几个小时后,编辑者给我修改的意见,其中最重要的是:a systematic error for the reflections in the resolution shell 0.93-0.89 A (see SHELXL output file - most disagreable reflections). This is a source of large peaks and holes in the final  difference Fourier map. The data have to be reprocessed and the scaling procedure carrefully checked.于是我就将一些衍射点用omit指令,GooF从1.276降到1.1几了,但是权重也改变了,再权重计算时,GooF又升为1.27了,(我是从Delta(F^2)/esd大于5以上的用omit),而且Delta(F^2)/esd  中又有很多大于5的。请问这该怎么办呀?谢谢赐教。
10楼2010-07-09 09:44:47
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)


日不落(金币+5):谢谢热情解答! 2010-07-08 10:35:21
yunruirui(金币+1):谢谢交流,希望常来 2010-07-08 12:53:49
日不落(金币+1): 2010-07-10 19:49:22
omit一般删掉一些不好的点 或者截分辨率
exti应该是消光系数 我都是根据软件的提示加上的

一般根据res中的权重修到R 和 GooF合理就好了 具体不是很清楚
2楼2010-07-08 10:16:23
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日不落

金虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by huahua1216 at 2010-07-08 10:16:23:
omit一般删掉一些不好的点 或者截分辨率
exti应该是消光系数 我都是根据软件的提示加上的

一般根据res中的权重修到R 和 GooF合理就好了 具体不是很清楚

还想问一下,修改权重的时候,上下的权重值一定要差不多吗?谢谢赐教!
3楼2010-07-08 10:37:08
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)


日不落(金币+1):哦,谢谢 2010-07-08 11:13:50
yunruirui(金币+1):谢谢交流,希望常来 2010-07-08 12:54:19
引用回帖:
Originally posted by 日不落 at 2010-07-08 10:37:08:

还想问一下,修改权重的时候,上下的权重值一定要差不多吗?谢谢赐教!

最好和res提示的一样吧
4楼2010-07-08 10:59:22
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