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babaleo

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】算VASP弹性常数时的能量-应变出错 已有12人参与

用侯老师的脚本练习算弹性常数时出错, 以C33为例,
(1) 用侯老师文中INCAR, 开始时设ISIF=4 优化, 优化后的POSCAR拷成OLDPOS
(2)加e3=delta, 改defvector.f 中strain(i) 并编译,以此来算对应的基矢
(3)用侯老师的脚本算应变区间-0.012 到0.012(步长0.003)的弛豫和能量, 然后拟合能量-应变曲线.
可是得到的能量-应变曲线怎么不是原点对称的呢?哪一步出错了?恳请大虾指点.
图中红色是计算结果,蓝色是拟合deltaE/V=3C33^2/2

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thinkllh

铁杆木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个是有步骤的:
1. 计算体系E-V关系,每个体积V下先采用ISIF=4,保持体积不变,优化晶格形状和离子位置,ISMEAR取0或1(对金属),优化完之后要增加一步静态能量计算,一般ISMEAR=-5.
2. 拟合E-V关系,找到能量最小点的体积(推荐采用Gibbs2程序计算,如果不知道,请自行搜索,本版有我多个相关回复)。
3. 在最小体积下设置ISIF=4,优化晶格形状和离子位置,一遍不放心就两遍吧,最终的CONTCAR即为最稳定构型。
4. 基于上述稳定构型,采用应力-应变方法或应力-应变能方法,后者可根据侯老师教程或直接在VASP中设置IBRION=6计算,采用侯老师的方法是变形之后先优化再计算静态能,精度更高。

Note:
1. 直接采用ISIF=3得到的CONTCAR是不能用的,尤其是较复杂的体系,不信可以grep volume vasprun.xml,一般最后几步的体积都在个位数上震荡;采用上述方法得到的最小能量对应体积精度一般在小数点之后,
2. 凡是想要得到比较精确的稳定结构的,建议都采用上述1-3步逐步施行。
3. 以上是本人失败了N次之后总结出来的,这样得到的应力-应变能曲线对称性很高,特此分享,以帮助各位少走弯路。

[ Last edited by thinkllh on 2012-6-14 at 09:22 ]
Thinkwiththeworld.
7楼2012-06-14 09:18:56
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sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+1):谢谢建议 2010-08-26 09:02:45
建议初始优化设置ISIF=3,一般这样优化出来的晶格参数就很接近能量最小值了
心之所向无惧无悔
3楼2010-08-25 23:38:47
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普通回帖

wangle_xq

银虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+1):谢谢讨论 2010-08-26 09:02:36
不是原点对称,意味着没有找到能量最低点。原因么,还是晶格优化没到位。按照你现在的图,选取0.0025位置的晶格参数应该就可以了。

个人观点,欢迎讨论。
网络日志 http://blog.163.com/wangle_xq/ 关注计算材料科学的应用,以及相关的计算机技术。文章以转贴为主,少量原创。欢迎参观
2楼2010-08-25 22:27:05
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babaleo

木虫 (正式写手)

谢谢讨论和建议. 看来我是需要再重新优化.
4楼2010-08-26 09:41:20
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ufo991

铁虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
1860789楼: Originally posted by babaleo at 2010-08-25 12:23:37
用侯老师的脚本练习算弹性常数时出错, 以C33为例,
(1) 用侯老师文中INCAR, 开始时设ISIF=4 优化, 优化后的POSCAR拷成OLDPOS
(2)加e3=delta, 改defvector.f 中strain(i) 并编译,以此来算对应的基矢
(3)用侯老师的 ...

你好,请问你这个问题解决了嘛?是因为结构没优化好的原因嘛?我计算的一正交结构在有些形变的时候是对称分布,有些不是。如C11时最低能量点出现在detal=0.003时候,C22时出现在detal=-0.003时,能否请教一下?
5楼2012-06-11 09:11:01
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babaleo

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2458418楼: Originally posted by ufo991 at 2012-06-11 09:11:01
你好,请问你这个问题解决了嘛?是因为结构没优化好的原因嘛?我计算的一正交结构在有些形变的时候是对称分布,有些不是。如C11时最低能量点出现在detal=0.003时候,C22时出现在detal=-0.003时,能否请教一下?...

可能是结构没优化好的原因. 不过后来看了其他帖, 就开始并一直用应力应变方法算了.
6楼2012-06-14 08:14:58
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mousekingadv

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
2458715楼: Originally posted by thinkllh at 2012-06-14 09:18:56
这个是有步骤的:
1. 计算体系E-V关系,每个体积V下先采用ISIF=4,保持体积不变,优化晶格形状和离子位置,ISMEAR取0或1(对金属),优化完之后要增加一步静态能量计算,一般ISMEAR=-5.
2. 拟合E-V关系,找到能量 ...

谢谢分享!虽然我不做应力-应变优化,还是很有帮助
8楼2012-06-15 20:22:09
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fjfuzhou

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
2458715楼: Originally posted by thinkllh at 2012-06-14 09:18:56
这个是有步骤的:
1. 计算体系E-V关系,每个体积V下先采用ISIF=4,保持体积不变,优化晶格形状和离子位置,ISMEAR取0或1(对金属),优化完之后要增加一步静态能量计算,一般ISMEAR=-5.
2. 拟合E-V关系,找到能量 ...

你的意思就是先进性E-V计算,得到最小体积,然后在最小体积下设置ISIF=4?         -->得到contcar,然后转化成为OLDPOS?
9楼2012-11-14 11:41:44
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tonglijia

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6328686麻烦您给解答下!!!!十分感激!!!
人,要靠自己!!!
10楼2013-09-07 22:08:23
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